RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GTT2	Q12390	233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	POM34	Q12445	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	REP1	P03871	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	REV1	P12689	985 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	EPT1	P22140	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	URK1	P27515	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NUF2	P33895	451 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	INM1	P38710	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	DBP8	P38719	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MTG2	P38860	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IPT1	P38954	527 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	JHD1	P40034	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SOK1	P40317	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IRC6	P43615	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YJR030C	P47101	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	BIO3	P50277	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TWF1	P53250	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YNL181W	P53878	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YNL140C	P53910	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	COG5	P53951	403 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RRN5	Q02983	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MGR3	Q04472	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ARP10	Q04549	284 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GRS2	Q06817	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GSH2	Q08220	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RIB3	Q99258	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ALG7	P07286	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TRX3	P25372	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RER1	P25560	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SER33	P40510	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SMK1	P41808	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YJR149W	P47177	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PRM8	P53174	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IGO1	P53897	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	FDC1	Q03034	503 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	VHS1	Q03785	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	KRE28	Q04431	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TMN2	Q04562	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GAD1	Q04792	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	VID22	Q05934	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ORM2	Q06144	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	COS7	Q07788	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TRM10	Q12400	293 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TAO3	P40468	2376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YPR096C	O13587	100 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SPO23	P33757	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TOD6	P34219	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PXA2	P34230	853 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GMH1	P36125	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IML3	P38265	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	AXL2	P38928	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SPO73	P40031	143 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YFR020W	P43600	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YJL055W	P47044	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YJL043W	P47053	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	BUL1	P48524	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TOM22	P49334	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MDM34	P53083	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MPS2	P53159	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	COG7	P53195	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MTL1	P53214	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NUP49	Q02199	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MAK3	Q03503	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GAL83	Q04739	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	VPS74	Q06385	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MDM36	Q06820	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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