RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	OXA1	P39952	402 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	YDR061W	Q12298	539 aa		3.23	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	PCL1	P24867	279 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	PRR1	P28708	518 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	CLD1	P53264	445 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	FCY22	Q12119	530 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	PCL9	Q12477	304 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ATG34	YOL083W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SPO23	P33757	523 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	DAD2	P36162	133 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	PES4	P39684	611 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	HAL1	Q01766	294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YET2	Q04210	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SFG1	Q12507	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YER186C	P40101	306 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	DFG10	P40526	253 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	LIP2	Q06005	328 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	GAT3	Q07928	141 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	PEX27	Q08580	376 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	NFI1	Q12216	726 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	UTH1	P36135	365 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	ECM8	P38246	354 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	RET3	P53600	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YNR068C	P53754	272 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	PGC1	Q08959	321 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
ATG34	YOL083W	MRPL8	P22353	238 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	CDC50	P25656	391 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
ATG34	YOL083W	MSK1	P32048	576 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	OM14	P38325	134 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SPT7	P35177	1332 aa		3.18	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	VAM7	P32912	316 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YBL028C	P38202	106 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	TIM17	P39515	158 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SEC9	P40357	651 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	KEG1	P43614	200 aa		3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SIF2	P38262	535 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	PFS1	P38872	237 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	HEM14	P40012	539 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	CIN2	P46670	268 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	GPI8	P49018	411 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	YNL143C	P53908	130 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	AIM33	Q04516	312 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	SHS1	Q07657	551 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	MCT1	Q12283	360 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
ATG34	YOL083W	COX4	P04037	155 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PRB1	P09232	635 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RDS1	P25611	832 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MEP1	P40260	492 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	SNL1	P40548	159 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	PGU1	P47180	361 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MPS2	P53159	387 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	BSC6	Q08280	497 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	YOR012W	Q12351	137 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	MAS2	P11914	482 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATG34	YOL083W	ZRC1	P20107	442 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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