RNA–Protein interactions for RNA: YNL298W

CLA4, Transcript of Cdc42p-activated signal transducing kinase, yeast

Gene CLA4, Length 2,529 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLA4	YNL298W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLA4	YNL298W	RNH203	Q12338	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CLA4	YNL298W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RGT1	P32862	1170 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	CYM1	P32898	989 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	OCT1	P35999	772 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	STB1	P42845	420 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PHO86	P46956	311 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	BUL1	P48524	976 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	NMA2	P53204	395 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YNL146W	P53906	100 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MSH5	Q12175	901 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RKI1	Q12189	258 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	IES3	Q12345	250 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	KSS1	P14681	368 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	ITR1	P30605	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RRN10	P38204	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	FET3	P38993	636 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YGR151C	P53287	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	USV1	Q12132	391 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MYO1	P08964	1928 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	CHS1	P08004	1131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	ATO2	P32907	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	SYG1	P40528	902 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	SLT2	Q00772	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	AIM33	Q04516	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PEX27	Q08580	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	GET4	Q12125	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YOS9	Q99220	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	UBA4	P38820	440 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	SAS2	P40963	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YFH7	P43591	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	ORM1	P53224	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	IRC4	Q03036	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	TAF12	Q03761	539 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	FMN1	Q03778	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PLM2	Q04383	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RAX1	Q08760	435 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	VIK1	Q12045	647 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	ECM25	P32525	599 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	COS9	P36034	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	GAA1	P39012	614 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YMR134W	P40207	237 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PAC11	P40960	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	LOH1	P47055	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MIG2	P53035	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RMR1	P53060	241 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YPR003C	P53394	754 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PDR8	Q06149	701 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	LAG2	Q92325	660 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	SNF3	P10870	884 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	EXO70	P19658	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	GPI12	P23797	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	ACH1	P32316	526 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	ATP11	P32453	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	RTC2	P38279	296 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	INM1	P38710	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	TRM5	P38793	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YJL163C	P46996	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YTP1	P53584	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MRPL22	P53881	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	NSG2	P53898	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	TRS23	Q03784	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	MSN2	P33748	704 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	AIM29	P36154	155 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	FES1	P38260	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	DBP8	P38719	431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	FUS2	Q05670	677 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	SYO1	Q07395	620 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	THP1	Q08231	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CLA4	YNL298W	UBA3	Q99344	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.7 ms