RNA–Protein interactions for RNA: YMR229C

RRP5, Transcript of RNA binding protein involved in synthesis of both 18S and 5.8S rRNAs, yeast

Gene RRP5, Length 5,190 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP5	YMR229C	YCT1	Q12235	531 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RMD5	Q12508	421 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CTF3	Q12748	733 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CDC21	P06785	304 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MSF1	P08425	469 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YCR015C	P25616	317 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RSC6	P25632	483 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PTC6	P25646	442 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YBR241C	P38142	488 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CTP1	P38152	299 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YBR071W	P38243	211 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MBP1	P39678	833 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YAL037W	P39728	267 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SLM1	P40485	686 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GAL83	Q04739	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YPR172W	Q06608	200 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RRI1	Q12468	440 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CDC7	P06243	507 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MET8	P15807	274 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CDC42	P19073	191 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PDC2	P32896	925 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	FLR1	P38124	548 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	POA1	P38218	177 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	IPT1	P38954	527 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RTS2	P40962	232 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GND2	P53319	492 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ECM9	Q02202	377 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NNT1	Q05874	261 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YPR196W	Q06595	470 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MFG1	Q07684	458 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PDX1	P16451	410 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	KRE6	P32486	720 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MTH1	P35198	433 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	FET3	P38993	636 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	COA1	P40452	197 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PMT4	P46971	762 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PRM15	Q03262	622 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YPQ2	Q06328	317 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	LCB4	Q12246	624 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	KIN28	P06242	306 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	STE12	P13574	688 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	UGA1	P17649	471 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	STE4	P18851	423 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PHO3	P24031	467 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SPT10	P35208	640 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YBR284W	P38150	797 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RPH1	P39956	796 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RRG9	P40156	214 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YGR210C	P42942	411 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	AGP3	P43548	558 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	CTF19	Q02732	369 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GIC2	Q06648	383 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SSK1	Q07084	712 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SRO7	Q12038	1033 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ACF2	Q12168	779 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RIB3	Q99258	208 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SAC7	P17121	654 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ADH7	P25377	361 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	ATG15	P25641	520 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	SIP1	P32578	815 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	DSS4	P32601	143 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	VAM7	P32912	316 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	GOS1	P38736	223 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NUP100	Q02629	959 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NUP53	Q03790	475 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	BNA7	Q04066	261 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	FMP42	Q04991	504 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	NDE2	Q07500	545 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	RRT8	Q08219	342 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	MRX4	Q12467	430 aa		3.15	□□□□□ -1.9
RRP5	YMR229C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RRP5	YMR229C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.2 ms