RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RPS31	YLR167W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS31	YLR167W	VTI1	Q04338	217 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS31	YLR167W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS31	YLR167W	CUR1	Q06469	252 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RPS31	YLR167W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MXR2	P25566	168 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MRPS5	P33759	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	AIM20	P40451	204 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SMP3	Q04174	516 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YRM1	Q12340	786 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	AHC1	Q12433	566 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RGS2	Q99188	309 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YHK8	P38776	514 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	REE1	P40893	198 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YFR018C	P43599	363 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YGL260W	P53056	76 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PBA1	Q05778	276 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	GAT3	Q07928	141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	APC5	Q08683	685 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	POP5	P28005	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RTC2	P38279	296 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YHR131C	P38835	850 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RTT105	P40063	208 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MAM33	P40513	266 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	LST7	P53237	242 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ALF1	P53904	254 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MTQ1	P53944	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	CAB5	Q03941	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	NAT4	Q04751	285 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	EAF3	Q12432	401 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RPB5	P20434	215 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	IST2	P38250	946 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SWC5	P38326	303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	KRE9	P39005	276 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	END3	P39013	349 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	KEG1	P43614	200 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	LCB3	P47013	409 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	AIM24	P47127	394 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	BOR1	P53838	576 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	TDA1	Q03533	586 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	OM45	P16547	393 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	FUN26	P31381	517 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YBL059W	P34224	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YHR182W	P38870	785 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YHR218W	P38899	603 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RBG1	P39729	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SNM1	P40993	198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	LOH1	P47055	219 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	APC2	Q12440	853 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PCL9	Q12477	304 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MSI1	P13712	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PUT4	P15380	627 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	UTR1	P21373	530 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	DCC1	P25559	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	CIN8	P27895	1000 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ERG9	P29704	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YPS1	P32329	569 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
RPS31	YLR167W	ATG7	P38862	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	SCS3	P53012	380 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	MST27	P53176	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	VOA1	P53262	265 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	ECM18	Q04623	453 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	RRG8	Q06109	277 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	YLH47	Q06493	454 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RPS31	YLR167W	FDH1	Q08911	376 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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