RNA–Protein interactions for RNA: YKR103W

NFT1, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene NFT1, Length 3,657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NFT1	YKR103W	IST2	P38250	946 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YHR078W	P38799	552 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	VPS45	P38932	577 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	NPR2	P39923	615 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	JHD1	P40034	492 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YJL107C	P42947	387 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	IRC8	P47046	822 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PMT5	P52867	743 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SGF73	P53165	657 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	INN1	P53901	409 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	MPS1	P54199	764 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RTT103	Q05543	409 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	FAR10	Q06001	478 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	XYL2	Q07993	356 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	HMS1	Q12398	434 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SNF8	Q12483	233 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	BIK1	P11709	440 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	MIH1	P23748	554 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GLG1	P36143	616 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RRN10	P38204	145 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
NFT1	YKR103W	BZZ1	P38822	633 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PLB1	P39105	664 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	BUR6	P40096	142 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YFL054C	P43549	646 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	FAR7	P43592	221 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	AMA1	P50082	593 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YMR010W	Q03687	405 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RRT8	Q08219	342 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	HER1	Q12276	1246 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	AGC1	Q12482	902 aa		2.58	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	MAS2	P11914	482 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	ERS1	P17261	260 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SNF5	P18480	905 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	CCA1	P21269	546 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PRE4	P30657	266 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	POP4	P38336	279 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	AIM2	P39721	246 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	UFE1	P41834	346 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	NSG2	P53898	299 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	KTR6	P54070	446 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	NRG1	Q03125	231 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YDR222W	Q04925	415 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	HOF1	Q05080	669 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GPN3	Q06543	272 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	REX4	Q08237	289 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YPL191C	Q08930	360 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	BTS1	Q12051	335 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SEC59	P20048	519 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	DAL2	P25335	343 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	STE50	P25344	346 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	ECM25	P32525	599 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GCS1	P35197	352 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	MCH2	P36032	473 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	ALY1	P36117	915 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	VMA7	P39111	118 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GID8	P40208	455 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	TAH11	P47112	604 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	AAD10	P47182	288 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	BUL1	P48524	976 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	STD1	Q02794	444 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YPL107W	Q02873	248 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SSY1	Q03770	852 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	IZH3	Q07959	543 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.57	□□□□□ -2	not detected
NFT1	YKR103W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PET20	Q99373	253 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	YBR085C-A	O43137	85 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	CLN3	P13365	580 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	EXO70	P19658	623 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	QDR3	P38227	689 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	GIC1	P38785	314 aa		2.57	□□□□□ -2
NFT1	YKR103W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms