RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	TOM22	P49334	152 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	INP2	Q03824	705 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	DON1	Q05610	365 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	FAR10	Q06001	478 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ASA1	Q06822	443 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	DDC1	Q08949	612 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SRO7	Q12038	1033 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SFM1	Q12314	213 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RNH203	Q12338	110 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RRI2	Q12348	645 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.58	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RED1	P14291	827 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SAG1	P20840	650 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	CLB3	P24870	427 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	DBF4	P32325	704 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YBR241C	P38142	488 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	GEP4	P38812	185 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	VHS2	P40463	436 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YJR030C	P47101	745 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YJR054W	P47114	497 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	BIO3	P50277	480 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	CDH1	P53197	566 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YGR015C	P53208	328 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MRX11	Q03079	207 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YMR155W	Q03795	547 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MRX8	Q05473	314 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	LDS2	Q08218	356 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ATP16	Q12165	160 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YOP1	Q12402	180 aa		0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	UNG1	P12887	359 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	DAL5	P15365	543 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ZIP1	P31111	875 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	PMT2	P31382	759 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YPS1	P32329	569 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	UTR5	P32630	166 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	PPQ1	P32945	549 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SLM4	P38247	162 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	INM1	P38710	295 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	NDE1	P40215	560 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YIL059C	P40520	121 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	PIB2	P53191	635 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ALF1	P53904	254 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RNH201	P53942	307 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	GAT3	Q07928	141 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YDL211C	Q12121	372 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	PCL9	Q12477	304 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MTR10	Q99189	972 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	AFI1	Q99222	893 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YRF1-4	O13559	1382 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	FLO11	P08640	1367 aa		0.56	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YPR096C	O13587	100 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	TPK3	P05986	398 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	CDC21	P06785	304 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPL12B	P0CX54	165 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SKT5	P34226	696 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ATM1	P40416	690 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YDR131C	Q03899	556 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	FSH2	Q05015	223 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YLR456W	Q06199	204 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YOL029C	Q08187	201 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	HIF1	Q12373	385 aa		0.55	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	HEM4	P06174	275 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ADK2	P26364	225 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	TKL2	P33315	681 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	QDR3	P38227	689 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	BDH1	P39714	382 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SCC4	P40090	624 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	UFE1	P41834	346 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	TCB2	P48231	1178 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SED5	Q01590	340 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	SCS7	Q03529	384 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	MIX17	Q03667	156 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	URC2	Q04411	772 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	API2	Q04413	109 aa		0.54	□□□□□ -2.32
BLI1	YKL061W	YDL121C	Q07541	149 aa		0.54	□□□□□ -2.32

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