RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A PFS1P38872 237 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A YGL262WP53054 175 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A VHT1P53241 593 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A MEH1Q02205 184 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A RNY1Q02933 434 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A ERO1Q03103 563 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A SXM1Q04175 944 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A MCH1Q07376 486 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A RPN5Q12250 445 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A SRN2Q99176 213 aa1.92□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A RRP7P25368 297 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A SOL2P37262 315 aa1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A LCB2P40970 561 aa1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A ASN2P49090 572 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A YIP5P53108 310 aa1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A REX2P54964 269 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A LDS2Q08218 356 aa1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A IES4Q08561 116 aa1.91□□□□□ -2.1
RPC10YHR143W-A ADH1P00330 348 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MRPL8P22353 238 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A CMK2P22517 447 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MNL1P38888 796 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MLH1P38920 769 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SEC27P41811 889 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ABM1P47146 123 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PGU1P47180 361 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YGR018CP53211 109 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A CWC22P53333 577 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ENT5Q03769 411 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MSC3Q05812 728 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YHC1Q05900 231 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A IPK1Q06667 281 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SFM1Q12314 213 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A HIF1Q12373 385 aa1.9□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A CHA1P25379 360 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ZUO1P32527 433 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ECT1P33412 323 aa1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A LRP1P38801 184 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A EFM4P40516 257 aa1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YFL012WP43580 148 aa1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A FLC3P53121 802 aa1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A APJ1P53940 528 aa1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YPL107WQ02873 248 aa1.89□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MAS2P11914 482 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RPL16AP26784 199 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A LDS1P31379 325 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PFF1P38244 976 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PEX22P39718 180 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SEC9P40357 651 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A KEG1P43614 200 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A CIN2P46670 268 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A VAC7P53950 1165 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MCT1Q12283 360 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RAX2Q12465 1220 aa1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PAR32Q12515 295 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A TPI1P00942 248 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ASP3-2P0CX77 362 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ASP3-3P0CX78 362 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ASP3-4P0CX79 362 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ASP3-1P0CZ17 362 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MNE1P24720 663 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SSE1P32589 693 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PEX5P35056 612 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A DTR1P38125 572 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SPP381P38282 291 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A GDT1P38301 280 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A CHL4P38907 458 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A GDI1P39958 451 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MLC1P53141 149 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RSC1P53236 928 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A FSH2Q05015 223 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A PIN3Q06449 215 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YFH1Q07540 174 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YDL109CQ12103 647 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A LDB17Q12342 491 aa1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A HEM4P06174 275 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A UNG1P12887 359 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A EFB1P32471 206 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ANP1P32629 500 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A TOA1P32773 286 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A MDL1P33310 695 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YBL028CP38202 106 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A WSC4P38739 605 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YHR177WP38867 453 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A EPL1P43572 832 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SEH1P53011 349 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RNH201P53942 307 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A YLR177WQ06251 628 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A SHS1Q07657 551 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A GAT3Q07928 141 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A ERP4Q12450 207 aa1.86□□□□□ -2.11
RPC10YHR143W-A RPS19AP07280 144 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
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