RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ENA1	P13587	1091 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RNQ1	P25367	405 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	NFS1	P25374	497 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	NPL6	P32832	435 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YBR139W	P38109	508 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	BIG1	P38813	335 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	IPT1	P38954	527 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TAT2	P38967	592 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MBP1	P39678	833 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	IRC24	P40580	263 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MRPS18	P42847	217 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	IRC5	P43610	853 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	STE24	P47154	453 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	HMS2	P47175	358 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SWS2	P53937	143 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ENA2	Q01896	1091 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RIM13	Q03792	727 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	KRE28	Q04431	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	DAL4	Q04895	635 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YPL191C	Q08930	360 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MMT2	Q08970	484 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	HER1	Q12276	1246 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SFM1	Q12314	213 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ENA5	Q12691	1091 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	GAL7	P08431	366 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SAM35	P14693	329 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YCK1	P23291	538 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	LYP1	P32487	611 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SKN1	P33336	771 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	LOT5	P34234	306 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YRO2	P38079	344 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SWP82	P43554	623 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MTQ1	P53944	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YMD8	Q03697	442 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RNH202	Q05635	350 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YOR389W	Q08912	624 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PUS9	Q12069	462 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TRM10	Q12400	293 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	CLB2	P24869	491 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MGR1	P25573	417 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PRO1	P32264	428 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ELO1	P39540	310 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RRG9	P40156	214 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YJL068C	P40363	299 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SLS1	P42900	643 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	BIT61	P47041	543 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ARP10	Q04549	284 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	VPS36	Q06696	566 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YOL107W	Q12239	342 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TPO5	P36029	618 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	DOA1	P36037	715 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YPK3	P38070	525 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YHR112C	P38716	378 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	FMO1	P38866	432 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	CTF8	P38877	133 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MNL1	P38888	796 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	IES5	P40060	125 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MET28	P40573	187 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ALR2	P43553	858 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TWF1	P53250	332 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	REC102	Q02721	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	THI73	Q07904	523 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	XYL2	Q07993	356 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	DIN7	Q12086	430 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MSH5	Q12175	901 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YPL066W	Q12194	479 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ARE1	P25628	610 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ARN2	P38724	620 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	YLF2	P38746	405 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	SBE22	P38814	852 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YCK1	YHR135C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5

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