RNA–Protein interactions for RNA: YHR133C

NSG1, Transcript of Protein involved in regulation of sterol biosynthesis, yeast

Gene NSG1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSG1	YHR133C	YHR210C	P38893	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	RCY1	P39531	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	YRB2	P40517	327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	YFL066C	P43538	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	SPT20	P50875	604 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	DAM1	P53267	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	ISU1	Q03020	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	RNH202	Q05635	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	REH1	Q06709	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	GLE1	Q12315	538 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NSG1	YHR133C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YCK1	P23291	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PTP2	P29461	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	LST4	P34239	828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	SIC1	P38634	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MBP1	P39678	833 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	SPO73	P40031	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	NUP57	P48837	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PRM8	P53174	237 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	TPC1	P53257	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YGR168C	P53293	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	SWP1	Q02795	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	VPS36	Q06696	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	REX3	Q12090	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	AI1	P03875	834 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	GPI12	P23797	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PMT2	P31382	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YBR285W	P38354	144 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	ANS1	P38832	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	COG3	P40094	801 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MPH1	P40562	993 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PMT3	P47190	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MON1	P53129	644 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	CUZ1	P53899	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	TRS23	Q03784	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	URC2	Q04411	772 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	VID22	Q05934	901 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	THI72	Q08579	599 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YDL211C	Q12121	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	SAC7	P17121	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	RHB1	P25378	209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PBN1	P25580	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	STP22	P25604	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	ORC2	P32833	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	LHS1	P36016	881 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	ALG3	P38179	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	ECM8	P38246	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	EXO84	P38261	753 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	ECM34	P38728	170 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	CTF8	P38877	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	TAT2	P38967	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PZF1	P39933	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	SMK1	P41808	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MAL11	P53048	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	LCL3	P53153	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YGR067C	P53243	804 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	MEP3	P53390	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YSA1	Q01976	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	SPO19	Q03029	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	INP1	Q03694	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	ATG17	Q06410	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	NFI1	Q12216	726 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PSF1	Q12488	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NSG1	YHR133C	COX1	P00401	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms