RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W EXG2P52911 562 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YMR087WQ04299 284 aa7.55□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W HOM3P10869 527 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W NIC96P34077 839 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W MAE1P36013 669 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W CHK1P38147 527 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W LSM12P38828 187 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data7.54□□□□□ -1.2not detected
YRF1-3YGR296W YJL045WP47052 634 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YJR115WP47152 169 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W PIR1Q03178 341 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YPQ1Q12010 308 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W KEX2P13134 814 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W PTR2P32901 601 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YPL068CQ02749 293 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RAD52P06778 471 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W MTC2P34246 357 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YBR032WP38223 100 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W CCT6P39079 546 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W DUG1P43616 481 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W PET494P07390 489 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W BUD32P53323 261 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W FMP45Q07651 309 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W SRO7Q12038 1033 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W SPO7P18410 259 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W TSR4P25040 408 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YBR241CP38142 488 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W UBX6P47049 396 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W COG1P53079 417 aa7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W ALG9P53868 555 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W LRG1P35688 1017 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W NAT2P37293 288 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YBR242WP38331 238 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W PKP1P40530 394 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W AZF1P41696 914 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W NPY1P53164 384 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W TIM11P81449 96 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W ABZ2Q03266 374 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YDR124WQ04608 324 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W CYK3Q07533 885 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W THI73Q07904 523 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RTN2Q12443 393 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RNA14P25298 677 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W TCA17P32613 152 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W MET30P39014 640 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W KRE29P40026 464 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RRG9P40156 214 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W FET5P43561 622 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W XYL2Q07993 356 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RTR2Q12378 196 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W OCA4P25366 362 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W TRX3P25372 127 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W HSP30P25619 332 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W AIM26P32858 118 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W FMP52P40008 231 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W AVT6P40074 448 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W ZIM17P42844 174 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W NBP35P52920 328 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YLR446WQ06204 433 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RIB3Q99258 208 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data7.53□□□□□ -1.2not detected
YRF1-3YGR296W HMS2P47175 358 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W MSE1P48525 536 aa7.53□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W DOA1P36037 715 aa7.52□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W YHR033WP38690 423 aa7.52□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W SER3P40054 469 aa7.52□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W DOT6P40059 670 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W RSM27P53305 110 aa7.52□□□□□ -1.2
YRF1-3YGR296W FUM1P08417 488 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W DSF1P0CX08 502 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YNR073CP0CX09 502 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W KRE6P32486 720 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W LOT5P34234 306 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YBR284WP38150 797 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W CTP1P38152 299 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SCS3P53012 380 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YMR130WQ04223 302 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W BAG7Q12128 409 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W PSF1Q12488 208 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YPL247CQ12523 523 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W SAC7P17121 654 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TEC1P18412 486 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W YAR1P46683 200 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W NUP57P48837 541 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ECM9Q02202 377 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W INH1P01097 85 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W TMA19P35691 167 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W ECM34P38728 170 aa7.52□□□□□ -1.21
YRF1-3YGR296W MNT3P40549 630 aa7.52□□□□□ -1.21
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