RNA–Protein interactions for RNA: YFL058W

THI5, Transcript of Protein involved in synthesis of the thiamine precursor HMP, yeast

Gene THI5, Length 1,023 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THI5	YFL058W	RHO4	Q00246	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SRL4	Q03085	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RIM13	Q03792	727 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ARP10	Q04549	284 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	DAL4	Q04895	635 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	DCI1	Q08558	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	PUS9	Q12069	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	BSC1	Q12140	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	MSH5	Q12175	901 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	NFI1	Q12216	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.64	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	COX3	P00420	269 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SIR3	P06701	978 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	GAL7	P08431	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	CLB2	P24869	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ITR2	P30606	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	DOA1	P36037	715 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SRX1	P36077	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YBR139W	P38109	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YHR112C	P38716	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RCY1	P39531	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	PAC11	P40960	533 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SNM1	P40993	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	HMS2	P47175	358 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SHE4	P51534	789 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	CDH1	P53197	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ASI1	P54074	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YMD8	Q03697	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YML096W	Q04489	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	GAL83	Q04739	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RSF1	Q05043	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RNH202	Q05635	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	XYL2	Q07993	356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	IES3	Q12345	250 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RED1	P14291	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	VPS33	P20795	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ARE1	P25628	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SSH4	P32343	579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	DOM34	P33309	386 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	NUF2	P33895	451 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	TPO5	P36029	618 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YPK3	P38070	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YRO2	P38079	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	BIG1	P38813	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	TAT2	P38967	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
THI5	YFL058W	LRO1	P40345	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YJL068C	P40363	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ALR2	P43553	858 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	EFM3	P47163	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	HXT16	P47185	567 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
THI5	YFL058W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	GPI17	Q04080	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	KRE28	Q04431	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	BOP2	Q06150	570 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YFT2	Q06676	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	RSC58	Q07979	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	GSH2	Q08220	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SKS1	Q12505	502 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	CCH1	P50077	2039 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	REP1	P03871	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	TFS1	P14306	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	MGR1	P25573	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
THI5	YFL058W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	SKN1	P33336	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	BAP2	P38084	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ARN2	P38724	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	FMO1	P38866	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	CTF8	P38877	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THI5	YFL058W	ELO1	P39540	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.7 ms