RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W POX1P13711 748 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W DAL81P21657 970 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W KRE6P32486 720 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W SHE1P38200 338 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W UBX7P38349 436 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TIF11P38912 153 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CSN12P47130 423 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YJR107WP47145 328 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GOR1P53839 350 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YSA1Q01976 231 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W IRC10Q08118 586 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ATG41Q12048 136 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YPR022CQ12139 1133 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W BSC1Q12140 328 aa12.04□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TDH1P00360 332 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YCP4P25349 247 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CDC12P32468 407 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VAM7P32912 316 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W CDS1P38221 457 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W IMD2P38697 523 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GID8P40208 455 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YNL140CP53910 189 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YLR040CQ07988 224 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W RKM5Q12367 367 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W PRE7P23724 241 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VPH1P32563 840 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W DSS4P32601 143 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W APE3P37302 537 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W HTD2P38790 280 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W GLR1P41921 483 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W MUP1P50276 574 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W COS10P52924 374 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VOA1P53262 265 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YNL143CP53908 130 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W VBA1Q04301 562 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ATG38Q05789 226 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W ISN1Q99312 450 aa12.03□□□□□ -0.48
SSA4YER103W YPR096CO13587 100 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PHO5P00635 467 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W APA2P22108 325 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YIM1P28625 365 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SUR1P33300 382 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SFC1P33303 322 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W DRE2P36152 348 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W AIM46P38885 310 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TAT2P38967 592 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W IME4P41833 600 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W BFA1P47113 574 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W AIM25P47140 327 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YPL113CQ02961 396 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RIM13Q03792 727 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YPL066WQ12194 479 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PCC1Q3E833 88 aa12.02□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RAS1P01119 309 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PRE4P30657 266 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TIP20P33891 701 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data12.01□□□□□ -0.49not detected
SSA4YER103W EXG2P52911 562 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W GPG1P53130 126 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YLR099W-AQ3E798 87 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-DR4O74302 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-AP0CX57 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-PR1P0CX58 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-ORP0CX59 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-PR2P0CX60 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-DR5P0CX65 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-ER2P0CX66 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-GR3P0CX67 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-LR1P0CX68 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-MR2P0CX69 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W AHC2P25649 128 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TIM23P32897 222 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W GPT2P36148 743 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SIF2P38262 535 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YHR122WP38829 231 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ALP1P38971 573 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PAM16P42949 149 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-JR2P47099 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W SNN1P48232 102 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PEF1P53238 335 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-DR1Q03856 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W NNT1Q05874 261 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-BRQ12217 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W PST1Q12355 444 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RDI1Q12434 202 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-NL2Q12470 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W TY1A-GR2Q12485 440 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W STT4P37297 1900 aa12.01□□□□□ -0.49
SSA4YER103W LEU4P06208 619 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W ARG80P07249 177 aa12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W RPE1P46969 238 aa12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W FOL2P51601 243 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SSA4YER103W MTL1P53214 551 aa12□□□□□ -0.49
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