RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W FUN26P31381 517 aa2.51□□□□□ -2.01
NTF2YER009W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YER186CP40101 306 aa2.51□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SEC27P41811 889 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YDL199CQ12407 687 aa2.51□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SCH9P11792 824 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W DAP2P18962 818 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W CDC50P25656 391 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MSP1P28737 362 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W FAA1P30624 700 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SPO23P33757 523 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YBL028CP38202 106 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W OM14P38325 134 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YPL107WQ02873 248 aa2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MRPL8P22353 238 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W PSO2P30620 661 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W IES6P32617 166 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W DAD2P36162 133 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W PFS1P38872 237 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W TIM17P39515 158 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W AIP1P46680 615 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W REX2P54964 269 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W GAT3Q07928 141 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W BSC6Q08280 497 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W PEX27Q08580 376 aa2.49□□□□□ -2.01
NTF2YER009W COX4P04037 155 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W CHA1P25379 360 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MSK1P32048 576 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W BLI1P35727 113 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W APE4P38821 490 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W LYS12P40495 371 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W TRF5P48561 642 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W RET3P53600 189 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YNR068CP53754 272 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YHC1Q05900 231 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YPR078CQ06813 372 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W NFI1Q12216 726 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YOR338WQ99326 363 aa2.48□□□□□ -2.01
NTF2YER009W PRB1P09232 635 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W ZRC1P20107 442 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W DBR1P24309 405 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W GIT1P25346 518 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W DEP1P31385 405 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SWI3P32591 825 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MRP21P38175 177 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W LSM12P38828 187 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SNL1P40548 159 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W KEG1P43614 200 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W CIN2P46670 268 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MPS2P53159 387 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W UTP6Q02354 440 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W YMR010WQ03687 405 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W SHS1Q07657 551 aa2.47□□□□□ -2.01
NTF2YER009W MAS2P11914 482 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W PHO84P25297 587 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W EFB1P32471 206 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W SSE1P32589 693 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W ALD5P40047 520 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W SEC9P40357 651 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W IGD1P43598 195 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W CTK3P46963 296 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W MRPS16Q02608 121 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W MSC3Q05812 728 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W YLH47Q06493 454 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W MCT1Q12283 360 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W HMS1Q12398 434 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W SFG1Q12507 346 aa2.46□□□□□ -2.02
NTF2YER009W RDS1P25611 832 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W VAM7P32912 316 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W GPI18P38211 433 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W PGU1P47180 361 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W AIM33Q04516 312 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W FSH3Q99369 266 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W PSK1P31374 1356 aa2.45□□□□□ -2.02
NTF2YER009W HEM4P06174 275 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W STE7P06784 515 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W THR4P16120 514 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W CMK2P22517 447 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data2.44□□□□□ -2.02not detected
NTF2YER009W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W HEM14P40012 539 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W YPS5P53057 165 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W MKC7P53379 596 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W YNL143CP53908 130 aa2.44□□□□□ -2.02
NTF2YER009W AQR1P53943 586 aa2.44□□□□□ -2.02
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