RNA–Protein interactions for RNA: YDR062W

LCB2, Transcript of Component of serine palmitoyltransferase, yeast

Gene LCB2, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB2	YDR062W	SHS1	Q07657	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RPN13	O13563	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CDC23	P16522	626 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	DAL2	P25335	343 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BNA6	P43619	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CGR1	P53188	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	GIM3	P53900	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CAC2	Q04199	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YPR1	Q12458	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MAS2	P11914	482 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
LCB2	YDR062W	YBR056W	P38081	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RIM2	P38127	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YEL020C	P39994	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YER085C	P40058	173 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MSS2	P40990	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RAD17	P48581	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PHB2	P50085	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YIP1	P53039	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	FMP30	Q02883	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SGT1	Q08446	395 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RAD9	P14737	1309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ARG80	P07249	177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	GPI12	P23797	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PHD1	P36093	366 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	LEU5	P38702	357 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
LCB2	YDR062W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	FMP33	P46998	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TOS2	P50078	622 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YGR168C	P53293	376 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ORT1	Q12375	292 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RRI1	Q12468	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MXR2	P25566	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CSM1	P25651	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	COX13	P32799	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YKL097C	P34245	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YCR041W	P37265	110 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	FMC1	P40491	155 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	IRC7	P43623	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PGA2	P53903	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	COX20	Q04935	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CTS2	Q06350	511 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BTS1	Q12051	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YRM1	Q12340	786 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ARP6	Q12509	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TPK3	P05986	398 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MSF1	P08425	469 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YKR015C	P36111	568 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SUN4	P53616	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SPP2	Q02521	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PNG1	Q02890	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RSN1	Q03516	953 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	GIS3	Q12418	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	HEM2	P05373	342 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SPO12	P17123	173 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	EXO70	P19658	623 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	LSB5	P25369	354 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TOA2	P32774	122 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	ELM1	P32801	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MNS1	P32906	549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	VAM7	P32912	316 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MRPS5	P33759	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	YKL162C	P36052	402 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SIP3	P38717	1229 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SBE22	P38814	852 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PAC2	P39937	518 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	DSE1	P40077	573 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CSM2	P40465	213 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	GND2	P53319	492 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BSC6	Q08280	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SRL2	Q12020	392 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	COQ3	P27680	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	MYO3	P36006	1272 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SHO1	P40073	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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