RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 USP17L19D6RCP7 530 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 USP17L20D6RJB6 530 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 H0YCG3 227 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 USP17L24Q0WX57 530 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 AP3B2Q13367 1082 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SLMAPQ14BN4 828 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CTAGE3PQ8IX95 158 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 COX16Q9P0S2 106 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CCDC188H7C350 402 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 MYO1FO00160 1098 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CSPG5O95196 566 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SEMA3FQ13275 785 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 AOC3Q16853 763 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TMC4Q7Z404 712 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TRIM11Q96F44 468 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.01□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 MUM1Q2TAK8 710 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RNF207Q6ZRF8 634 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RILPQ96NA2 401 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 PI4KBQ9UBF8 816 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 HSPA6P17066 643 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 PRPSAP1Q14558 356 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SULF1Q8IWU6 871 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ATP2A3Q93084 1043 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 EFCC1Q9HA90 598 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 HPSEQ9Y251 543 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SGK1O00141 431 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RHOBTB3O94955 611 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 E2F5Q15329 346 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 C12orf60Q5U649 245 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 FLAD1Q8NFF5 587 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 PPP4R1Q8TF05 950 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 VCXQ9H320 206 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SNX12Q9UMY4 172 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RASGRF2O14827 1237 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RPS6KA4O75676 772 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CD44P16070 742 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 MS4A14Q96JA4 679 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TBK1Q9UHD2 729 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 HPCAL4Q9UM19 191 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 POTEFA5A3E0 1075 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 POTEIP0CG38 1075 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 BPIFB4P59827 614 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 GPSM2P81274 684 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 POTEGQ6S5H5 508 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 POTEEQ6S8J3 1075 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 NME8Q8N427 588 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SPATA4Q8NEY3 305 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 C7orf25Q9BPX7 421 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TRIM9Q9C026 710 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 POLD4Q9HCU8 107 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 NARFQ9UHQ1 456 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 LRFN2Q9ULH4 789 aa9□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RINT1Q6NUQ1 792 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TCP11Q8WWU5 503 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CD209Q9NNX6 404 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 AKT3Q9Y243 479 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 HIP1RO75146 1068 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ADCY2Q08462 1091 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RUBCNQ92622 972 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 COA1Q9GZY4 146 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 NWD1Q149M9 1564 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 PSMD14O00487 310 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 KRT1P04264 644 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 LMNB2Q03252 620 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RFX6Q8HWS3 928 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 MEGF6O75095 1541 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 STXBP3O00186 592 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 CCND2P30279 289 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 MXI1P50539 228 aa8.99□□□□□ -0.97
ALMS1-208ENST00000620466 TFDP1Q14186 410 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms