RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533080.5

TSPAN18-211, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN18, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-211ENST00000533080 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 RGS18Q9NS28 235 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 HOXA2O43364 376 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ERVFC1P60507 584 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 KRT17Q04695 432 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 KCNC3Q14003 757 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 PLCB4Q15147 1175 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 NBL1P41271 181 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 NUCB1Q02818 461 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ITIH3Q06033 890 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 MCTP2Q6DN12 878 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 PCYT2Q99447 389 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TCF25Q9BQ70 676 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 SENP2Q9HC62 589 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 GINS2Q9Y248 185 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 FAM186AA6NE01 2351 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 NFASCO94856 1347 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 C9IYK1 514 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 CYP21A2P08686 494 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ACTR2P61160 394 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 MTA3Q9BTC8 594 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 USP34Q70CQ2 3546 aa22.14■■□□□ 1.14
TSPAN18-211ENST00000533080 PRR23AA6NEV1 266 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 HBP1O60381 514 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 TMTC2Q8N394 836 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 COL1A2P08123 1366 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 E7EWF7 191 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 KLRC1P26715 233 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 MTHFRP42898 656 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 FAM160B1Q5W0V3 765 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ABI1Q8IZP0 508 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF558Q96NG5 402 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CFAP54Q96N23 3096 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 MGEA5O60502 916 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CALM1P0DP23 149 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CALM2P0DP24 149 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CALM3P0DP25 149 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 PDE4AP27815 886 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CASC1Q6TDU7 716 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 TMC7Q7Z402 723 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 LRRC43Q8N309 656 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CWH43Q9H720 699 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CLCN5P51795 746 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 FAM189BP81408 668 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 APOL5Q9BWW9 433 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 SPG21Q9NZD8 308 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 BACH1O14867 736 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ATG7O95352 703 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 APOBRQ0VD83 1088 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 UBE2SQ16763 222 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN18-211ENST00000533080 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms