RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 CHMP4BP1P59074 171 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ITIH3Q06033 890 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PPIL2Q13356 520 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PPP2R5CQ13362 524 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 NNTQ13423 1086 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 WHAMMQ8TF30 809 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 RMDN3Q96TC7 470 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 MTRQ99707 1265 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TRIM9Q9C026 710 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.35□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PODXLO00592 558 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 LARGE1O95461 756 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PHBP35232 272 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 SKAP1Q86WV1 359 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ITGB4P16144 1822 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 CYP2C8P10632 490 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 LAMB3Q13751 1172 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PCGF5Q86SE9 256 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 CCDC102AQ96A19 550 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PGBD1Q96JS3 809 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 JMJD4Q9H9V9 463 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZNF302Q9NR11 478 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 CCDC151A5D8V7 595 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 CABYRO75952 493 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PLS3P13797 630 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 BACE1P56817 501 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 COASYQ13057 564 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 USH1GQ495M9 461 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 C8orf74Q6P047 294 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 PEX26Q7Z412 305 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 WRNIP1Q96S55 665 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 NUP98P52948 1817 aa6.34□□□□□ -1.39
POLK-215ENST00000514141 BCORQ6W2J9 1755 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FAM187AA6NFU0 413 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 HOXA2O43364 376 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 LPXNO60711 386 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FAM163BP0C2L3 166 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SETSIPP0DME0 302 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 KRT10P13645 584 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 GRM1Q13255 1194 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SLMAPQ14BN4 828 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 PI16Q6UXB8 463 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DPP9Q86TI2 863 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 CEP170P1Q96L14 293 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MMP19Q99542 508 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 FANCLQ9NW38 375 aa6.34□□□□□ -1.4
POLK-215ENST00000514141 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.34□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms