RNA–Protein interactions for RNA: YOL082W

ATG19, Transcript of Receptor protein for the cytoplasm-to-vacuole targeting (Cvt) pathway, yeastyeast

Gene ATG19, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG19YOL082W COX4P04037 155 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.47□□□□□ -1.85not detected
ATG19YOL082W COX13P32799 129 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W OM14P38325 134 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W FAD1P38913 306 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W YER186CP40101 306 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W YGR117CP53270 476 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W NAG1Q8TGN9 163 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W FAB1P34756 2278 aa3.47□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W THO2P53552 1597 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
ATG19YOL082W SIN3P22579 1536 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W ALG1P16661 449 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W MKC7P53379 596 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W MRPS16Q02608 121 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W VHS1Q03785 461 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W DCI1Q08558 271 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W UAF30Q08747 228 aa3.46□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W ECM5Q03214 1411 aa3.45□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86 RIP-Chip
ATG19YOL082W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W YPR091CQ06833 770 aa3.45□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W MFG1Q07684 458 aa3.45□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W SKT5P34226 696 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W GPI16P38875 610 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W SEO1P39709 593 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W NSE1Q07913 336 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W YBL111CQ3E7Y5 667 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W TAF2P23255 1407 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W LTV1P34078 463 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W MRPS9P38120 278 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W GPI18P38211 433 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W STE24P47154 453 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W APJ1P53940 528 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W YPQ1Q12010 308 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W FCY22Q12119 530 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W SSK2P53599 1579 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W PDE2P06776 526 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
ATG19YOL082W ATM1P40416 690 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W YDL114WQ07530 308 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W GPM3Q12326 303 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W RNH203Q12338 110 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W YOP1Q12402 180 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W CCH1P50077 2039 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W MDS3P53094 1487 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W OPI3P05375 206 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W PRB1P09232 635 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W ZRC1P20107 442 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W PHO91P27514 894 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W GPX2P38143 162 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W QDR3P38227 689 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W ECM8P38246 354 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W TIM17P39515 158 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W YPS5P53057 165 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W ROG1P53118 685 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W ECM11Q04110 302 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ATG19YOL082W TPK3P05986 398 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W RPL12BP0CX54 165 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W DOA1P36037 715 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PFS1P38872 237 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PGU1P47180 361 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W TOS2P50078 622 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ECM7Q06200 448 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W SMC6Q12749 1114 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ARF1P11076 181 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W FUN26P31381 517 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
ATG19YOL082W IGD1P43598 195 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YGL262WP53054 175 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W KTR6P54070 446 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YDL199CQ12407 687 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ATG2P53855 1592 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W ADH1P00330 348 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W DEP1P31385 405 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YSC83P32792 385 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W GEP4P38812 185 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PAC11P40960 533 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W PMT5P52867 743 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG19YOL082W YGR018CP53211 109 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.6 ms