RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W DON1Q05610 365 aa2.69□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SUI3P09064 285 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-LR1P0C2J4 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-FP0CX61 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-GR2P0CX62 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MAK32P23060 363 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-CP25383 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PRE4P30657 266 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YBR144CP34215 104 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ALY1P36117 915 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W LYS9P38999 446 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W STB4P50104 949 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AAT1Q01802 451 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-DR2Q03483 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-BQ12260 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-OR2Q12293 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-DR1Q12392 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-OR1Q12439 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ZPS1Q12512 249 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TY2A-DR3Q99303 438 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YAK1P14680 807 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SPO11P23179 398 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YIH1P25637 258 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YEF1P32622 495 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W END3P39013 349 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PAN6P40459 309 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W EFM4P40516 257 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W URB2P47108 1174 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AAD10P47182 288 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MND1P53102 219 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CRZ1P53968 678 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DIT1P21623 536 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MRPL37P36532 105 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CDS1P38221 457 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PHO90P39535 881 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MAD2P40958 196 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SNF12P53628 566 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ARO80Q04052 950 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W VPS38Q05919 439 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GAS2Q06135 555 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YLR413WQ06689 675 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YOL075CQ08234 1294 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YOR114WQ12219 294 aa2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RPL3P14126 387 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MRP20P32387 263 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ECM25P32525 599 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PPQ1P32945 549 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.67□□□□□ -1.98 RIP-Chip
SIN3YOL004W MUP3P38734 546 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YCK3P39962 524 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W LRO1P40345 661 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W HXT14P42833 540 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ARG5,6Q01217 863 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YDR209CQ03480 137 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YER190C-BP0CX94 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YEL077W-AP0CX95 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YGR296C-BP0CX96 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YPL283W-BP0CX97 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YPR204C-AP0CX98 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YFL068WP0CX99 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YLL066W-AP0CY00 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YLL067W-AP0CY01 160 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YPT7P32939 208 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YMR262WP38430 313 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SSY1Q03770 852 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PUS9Q12069 462 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W AEP3Q12089 606 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RAX2Q12465 1220 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W URA3P03962 267 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YML003WP0CF16 290 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data2.67□□□□□ -1.98not detected
SIN3YOL004W FRS1P15624 595 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W CAP1P28495 268 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SET3P36124 751 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W SDH4P37298 181 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W OSH7P38755 437 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YHR210CP38893 341 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TWF1P53250 332 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YNR062CP53748 327 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data2.67□□□□□ -1.98not detected
SIN3YOL004W SWM1Q12379 170 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W RGS2Q99188 309 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W FMP27Q06179 2628 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W GPA1P08539 472 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W MRS3P10566 314 aa2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W TAL1P15019 335 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
SIN3YOL004W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
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