RNA–Protein interactions for RNA: YKL103C

APE1, Transcript of Vacuolar aminopeptidase yscI, yeast

Gene APE1, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APE1	YKL103C	ACH1	P32316	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	PHO86	P46956	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	YGR151C	P53287	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	IZH1	Q03419	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	PLM2	Q04383	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	COQ11	Q05892	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	GMC2	Q06201	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	ARR2	Q06597	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	SRO7	Q12038	1033 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RKI1	Q12189	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
APE1	YKL103C	RGS2	Q99188	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	FSH3	Q99369	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	IML1	P47170	1584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	SIR3	P06701	978 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	MET3	P08536	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	BNA4	P38169	460 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	LDB7	P38210	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	YEL020C	P39994	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	YPS6	P40583	537 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	SAS2	P40963	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	NMA2	P53204	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	TRS23	Q03784	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	BUR2	Q05949	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RAD9	P14737	1309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	PMA2	P19657	947 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	DOA1	P36037	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	STP2	P38704	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	BIG1	P38813	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	UBA4	P38820	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	DSE1	P40077	573 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	SNG1	P46950	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	AIM33	Q04516	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RTT103	Q05543	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	IRC13	Q08630	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	USV1	Q12132	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	RNH203	Q12338	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	DRS2	P39524	1355 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APE1	YKL103C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YAK1	P14680	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	STE4	P18851	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DAL82	P21705	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ATP7	P30902	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YMR134W	P40207	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	POP1	P41812	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YGR168C	P53293	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	HSP31	Q04432	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SEY1	Q99287	776 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DNF2	Q12675	1612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RAD7	P06779	565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DST1	P07273	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CHO1	P08456	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	RRT12	P25381	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	VPS51	P36116	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	HIS2	P38635	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PFS1	P38872	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SUR2	P38992	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DUG3	P53871	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YNL181W	P53878	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DIA1	P54005	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ORC3	P54790	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PFA5	Q03289	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	NUP53	Q03790	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DUS4	Q06063	367 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	CDA2	Q06703	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	DAP1	Q12091	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	SIA1	Q12212	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	PDR11	P40550	1411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APE1	YKL103C	OPI3	P05375	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 80.6 ms