RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	TOM20	P35180	183 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RSM22	P36056	628 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YAP3	P38749	330 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	0.31	□□□□□ -2.36	not detected
CSE1	YGL238W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YIP5	P53108	310 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ROG1	P53118	685 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	NUP116	Q02630	1113 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TAF12	Q03761	539 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	LDS2	Q08218	356 aa		0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	IRA1	P18963	3092 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SEM1	O94742	89 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	COX3	P00420	269 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPL43B	P0CX26	92 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RML2	P32611	393 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TOA2	P32774	122 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PDC2	P32896	925 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SCC4	P40090	624 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	STB1	P42845	420 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	BIR1	P47134	954 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ECM27	P47144	725 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HOT1	Q03213	719 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GYL1	Q04322	720 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YMR018W	Q04364	514 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TAO3	P40468	2376 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GAL80	P04387	435 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.3	□□□□□ -2.36	not detected
CSE1	YGL238W	DAL5	P15365	543 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GPI18	P38211	433 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TRR2	P38816	342 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	POP1	P41812	875 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YFL012W	P43580	148 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YJR030C	P47101	745 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TOS2	P50078	622 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MRM2	P53123	320 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	VPS75	P53853	264 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	VAC7	P53950	1165 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YDL114W	Q07530	308 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RIM20	Q12033	661 aa		0.3	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RHO2	P06781	192 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	DEP1	P31385	405 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YPS1	P32329	569 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YEF1	P32622	495 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TOA1	P32773	286 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SLC1	P33333	303 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ABM1	P47146	123 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PIB2	P53191	635 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RRN9	P53437	365 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GRX6	Q12438	231 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SCEI	P03882	235 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	LYS14	P40971	790 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	PHO86	P46956	311 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	LCB3	P47013	409 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MTQ1	P53944	314 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HKR1	P41809	1802 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SSM4	P40318	1319 aa		0.29	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MET8	P15807	274 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	KRE2	P27809	442 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	IES6	P32617	166 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	REG2	P38232	338 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RBG1	P39729	369 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YGR149W	P48236	432 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	COQ5	P49017	307 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	BIO3	P50277	480 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YGR066C	P53242	292 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	TWF1	P53250	332 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	GTO3	Q04806	366 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	LIP2	Q06005	328 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	MUM3	Q08750	479 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	ECM29	P38737	1868 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	RAD9	P14737	1309 aa		0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
CSE1	YGL238W	YCL068C	P25593	260 aa		0.28	□□□□□ -2.36

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