RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	SMP3	Q04174	516 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SPC2	Q04969	178 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CDC123	Q05791	360 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	DCR2	Q05924	578 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ATG17	Q06410	417 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	THP1	Q08231	455 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GPM2	Q12008	311 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MSH5	Q12175	901 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RNH203	Q12338	110 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	NPC2	Q12408	173 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RAD1	P06777	1100 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MAS2	P11914	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CKI1	P20485	582 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	POP5	P28005	173 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GDA1	P32621	518 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ERG28	P40030	148 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YNL194C	P40169	301 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MRPL22	P53881	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ROT1	Q03691	256 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ARP10	Q04549	284 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SPO77	Q06134	477 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	REX4	Q08237	289 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	AAD15	Q08361	143 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RUP1	Q12242	671 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	HTB2	P02294	131 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	DST1	P07273	309 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CNA1	P23287	553 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TMT1	P32643	299 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	COA1	P40452	197 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SAS2	P40963	338 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	POP1	P41812	875 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YJL163C	P46996	555 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SPT20	P50875	604 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PMT5	P52867	743 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RIM8	P53179	542 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ZRG17	P53735	605 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPL068C	Q02749	293 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TRS23	Q03784	219 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FAR8	Q05040	523 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ARO10	Q06408	635 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YDL086W	Q07505	273 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YOR389W	Q08912	624 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SIA1	Q12212	622 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	LCB4	Q12246	624 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	NCB2	Q92317	146 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	REV1	P12689	985 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CLN3	P13365	580 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	POX1	P13711	748 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MYO3	P36006	1272 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPT10	P38146	199 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	BNA4	P38169	460 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	FHL1	P39521	936 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	PHM8	P40025	321 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	LAS21	P40367	830 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YPS6	P40583	537 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	GAB1	P41733	394 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YGR210C	P42942	411 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	CHA4	P43634	648 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	AIM24	P47127	394 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	SSN8	P47821	323 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	MUP1	P50276	574 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	TAF6	P53040	516 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	NMA2	P53204	395 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	COG2	P53271	262 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	RRN9	P53437	365 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SLX8	YER116C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8

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