RNA–Protein interactions for RNA: YDR062W

LCB2, Transcript of Component of serine palmitoyltransferase, yeast

Gene LCB2, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB2	YDR062W	GPI1	P53306	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YNL260C	P53846	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	GPI15	P53961	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	TIM44	Q01852	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ATG34	Q12292	412 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	FSH3	Q99369	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	EDE1	P34216	1381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	CDC43	P18898	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ADY2	P25613	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ACH1	P32316	526 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MRP51	Q02950	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MMT1	Q03218	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	REX4	Q08237	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RKM5	Q12367	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	APC2	Q12440	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MER1	P16523	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	CTR86	P25355	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	CIN8	P27895	1000 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ECT1	P33412	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	FLO10	P36170	1169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	TAE1	P38340	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	TCD1	P38756	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PCP1	P53259	346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MPS1	P54199	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	AIM33	Q04516	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	IVY1	Q04934	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	BSP1	Q06604	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RNQ1	P25367	405 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	HXT1	P32465	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SKN1	P33336	771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	CAB3	P36076	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	APD1	P38281	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MNT4	P53745	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PET117	Q02771	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	DIC1	Q06143	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	NRT1	Q08485	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	AFT2	Q08957	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YCR007C	P25354	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	BUB3	P26449	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SUA5	P32579	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YMR262W	P38430	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	STE24	P47154	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	HMS2	P47175	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	TPO3	Q06451	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	LDS2	Q08218	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PFA4	Q12006	378 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RGS2	Q99188	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	GAL4	P04386	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PRB1	P09232	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
LCB2	YDR062W	YHR045W	P38775	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	FET3	P38993	636 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YMR134W	P40207	237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YJL070C	P40361	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MRK1	P50873	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	NUP100	Q02629	959 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SRL4	Q03085	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SLD5	Q03406	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SMP3	Q04174	516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	GPN3	Q06543	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ASA1	Q06822	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PUS9	Q12069	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CLN3	P13365	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	CKI1	P20485	582 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	DOA1	P36037	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	IML3	P38265	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	VRG4	P40107	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
LCB2	YDR062W	BIO3	P50277	480 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	TIM21	P53220	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
LCB2	YDR062W	GLO2	Q05584	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	COQ11	Q05892	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCB2	YDR062W	BUR2	Q05949	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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