RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 NME8Q8N427 588 aa21.34■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 WNT8BQ93098 351 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 VWCEQ96DN2 955 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SYF2-203ENST00000474160 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 NEMFO60524 1076 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 FOSBP53539 338 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 GUCY1B3Q02153 619 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 CUL4AQ13619 759 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 HAS1Q92839 578 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 UIMC1Q96RL1 719 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 VAV3Q9UKW4 847 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SQORQ9Y6N5 450 aa21.32■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 FAM205CA6NFA0 338 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 MAGEB2O15479 319 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 CHMP2AO43633 222 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 NBNO60934 754 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 OATP04181 439 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 ATP4AP20648 1035 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 IGBP1P78318 339 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 CALCRLQ16602 461 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 IER5Q5VY09 327 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 POTEDQ86YR6 584 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.31■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 GJB2P29033 226 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PSMC5P62195 406 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 GPNMBQ14956 572 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 APBB2Q92870 758 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SLC9A7Q96T83 725 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PPME1Q9Y570 386 aa21.3■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 M0QZ92 97 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PRKCEQ02156 737 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 EPHA7Q15375 998 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 XKR3Q5GH77 459 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 USP38Q8NB14 1042 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 NEK9Q8TD19 979 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 LRCH3Q96II8 777 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 MTMR9Q96QG7 549 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SCN5AQ14524 2016 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.29■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 H3BQV1 296 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 ZNF862O60290 1169 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 KLRC1P26715 233 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 QARSP47897 775 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 MGAT3Q09327 533 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 IKBKEQ14164 716 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 MBTPS1Q14703 1052 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 RAB30Q15771 203 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SEPT8Q92599 483 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 GJA10Q969M2 543 aa21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 ZBBXA8MT70 800 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB42B2RXF5 422 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 PDCP20941 246 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 TMOD1P28289 359 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 SNX21Q969T3 373 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 WDR81Q562E7 1941 aa21.27■■□□□ 1
SYF2-203ENST00000474160 C22orf31O95567 290 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 CHRNA1P02708 482 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 CTSHP09668 335 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 KCNJ6P48051 423 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 TTC38Q5R3I4 469 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 C4orf19Q8IY42 314 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 TET1Q8NFU7 2136 aa21.26■□□□□ 0.99
SYF2-203ENST00000474160 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms