RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 NEO1Q92859 1461 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PMLP29590 882 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 INPP1P49441 399 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PASD1Q8IV76 773 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 NDST4Q9H3R1 872 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ATP7BP35670 1465 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 RABGGTAQ92696 567 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED1O96006 694 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA17Q96L03 361 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 NMT2O60551 498 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 PBKQ96KB5 322 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 TSPOAP1O95153 1857 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 RESTQ13127 1097 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MTRQ99707 1265 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MOSPD1Q9UJG1 213 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MYL1P05976 194 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 SEPT2Q15019 361 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 SURF1Q15526 300 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 HACD3Q9P035 362 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPRM-201ENST00000332175 ECE2O60344 883 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PHEXP78562 749 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 DR1Q01658 176 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.08■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SNAP23O00161 211 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PNMA3Q9UL41 463 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 GDAQ9Y2T3 454 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SLMAPQ14BN4 828 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF4Q8WV16 495 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PIM2Q9P1W9 311 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8OA6NCC3 632 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 POTEMA6NI47 508 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8NF8WBI6 632 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 CDR2Q01850 454 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 MB21D1Q8N884 522 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 EVI5O60447 810 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SNCBQ16143 134 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 STK25O00506 426 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM67Q6ZTA4 783 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM42Q8IWZ5 723 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 FAF2Q96CS3 445 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 WRNIP1Q96S55 665 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED6P86452 979 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 RMDN3Q96TC7 470 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 F5H423 210 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 CXorf38Q8TB03 319 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TCP11Q8WWU5 503 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFA10O95299 355 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PRDX5P30044 214 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 CFLARO15519 480 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 CASP1P29466 404 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTPRM-201ENST00000332175 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 SYNE4Q8N205 404 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM260Q9NX78 707 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 KRT31Q15323 416 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 JAK3P52333 1124 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 STXBP2Q15833 593 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L15C9J2P7 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L11C9JVI0 530 aa24.04■■□□□ 1.44
PTPRM-201ENST00000332175 USP17L18D6R9N7 530 aa24.04■■□□□ 1.44
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