RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 GNA14O95837 355 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SERPINB3P29508 390 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 MAPK4P31152 587 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 RUNX1T1Q06455 604 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 DLGAP5Q15398 846 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TTC38Q5R3I4 469 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ACAD11Q709F0 780 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SYNJ2O15056 1496 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SERPINB4P48594 390 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 AP1S2P56377 157 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PSMC6P62333 389 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 LMBR1LQ6UX01 489 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 KCNH3Q9ULD8 1083 aa11.45□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 COBLO75128 1261 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 HPCAP84074 193 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 BBS9Q3SYG4 887 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 THTPAQ9BU02 230 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 AURKCQ9UQB9 309 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 C6orf118Q5T5N4 469 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CARD9Q9H257 536 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 KRT1P04264 644 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 KCNA2P16389 499 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PMS2P54278 862 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FANCCQ00597 558 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 MYO1EQ12965 1108 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TFDP1Q14186 410 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SYTL3Q4VX76 610 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PALB2Q86YC2 1186 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PRPSAP2O60256 369 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CLUP10909 449 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ITGA3P26006 1051 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SOX11P35716 441 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PDE6BP35913 854 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CNBD1Q8NA66 436 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PANK4Q9NVE7 773 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 H0Y3Z8 333 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 RGS5O15539 181 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SGO2Q562F6 1265 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ANKS6Q68DC2 871 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 RFX8Q6ZV50 586 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 GGA1Q9UJY5 639 aa11.44□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 GUCY2DQ02846 1103 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 RETREG2Q8NC44 543 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FAF2Q96CS3 445 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TNIP3Q96KP6 325 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 C4BPBP20851 252 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CCDC103Q8IW40 242 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ZNF197O14709 1029 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SOAT1P35610 550 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 CENPPQ6IPU0 288 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ADKP55263 362 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 GTF2H3Q13889 308 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TOMM20Q15388 145 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 DDB1Q16531 1140 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TIPRLO75663 272 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 ALDH1A2O94788 518 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 FBXO11Q86XK2 927 aa11.43□□□□□ -0.58
TNS3-201ENST00000311160 TTC8Q8TAM2 541 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms