RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RIM9Q04734 239 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C AIM41Q12032 185 aa3.33□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C REP1P03871 373 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C STE7P06784 515 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C VMA11P32842 164 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ASK1P35734 292 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MRPL39P36533 70 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ATG7P38862 630 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C AIM2P39721 246 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MET18P40469 1032 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C AGE2P40529 298 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C LYS5P50113 272 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SBH2P52871 88 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ACS1Q01574 713 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SED1Q01589 338 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C NCE101Q02820 53 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MET31Q03081 177 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SNX41Q04053 625 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ARR1Q06596 294 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YEH1Q07804 573 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C NMD4Q12129 218 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C LSP1Q12230 341 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YCL012CQ8J0M4 134 aa3.32□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C HEM2P05373 342 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C DST1P07273 309 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SKN7P38889 622 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C JEM1P40358 645 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C AYR1P40471 297 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C DJP1P40564 432 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C TFG2P41896 400 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C EGT2P42835 1041 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C NMD5P46970 1048 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.31□□□□□ -1.88not detected
SUP53tL(CAA)C ACS2P52910 683 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C IMA1P53051 589 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RMI1Q02685 241 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C VPS71Q03433 280 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C NHP10Q03435 203 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YDR249CQ03787 373 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SNA4Q07549 140 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YLR036CQ07986 203 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C GPB1Q08886 897 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YPR202WQ08993 238 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PSY3Q12318 242 aa3.31□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RNA1P11745 407 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SYP1P25623 870 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YPT7P32939 208 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SET3P36124 751 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YKR073CP36153 106 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SEC9P40357 651 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MOB2P43563 287 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SAE2P46946 345 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C TAF6P53040 516 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YNL140CP53910 189 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C BUR2Q05949 395 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PUN1Q06991 263 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CRT10Q08226 957 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YDL180WQ12301 547 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RMP1Q12530 201 aa3.3□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C CBS1P14066 229 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PDX1P16451 410 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RPB5P20434 215 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ROX1P25042 368 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PAP1P29468 568 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ECM8P38246 354 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YHL044WP38727 235 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C NSG1P38837 291 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C LNP1P38878 278 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C COA1P40452 197 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C GCD10P41814 478 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C ECL1P48235 211 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C DUO1P53168 247 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C MRP51Q02950 344 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RAD30Q04049 632 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YLR177WQ06251 628 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C EMG1Q06287 252 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RNH203Q12338 110 aa3.29□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C GPA2P10823 449 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C UTR1P21373 530 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SCO1P23833 295 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C SPO23P33757 523 aa3.28□□□□□ -1.88
SUP53tL(CAA)C YKL107WP34251 309 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms