RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	REV1	P12689	985 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
DSE3	YOR264W	SKN1	P33336	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SWD3	P38123	315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	QDR3	P38227	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	COX14	P39103	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SIM1	P40472	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	PEX25	Q02969	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	CEX1	Q12453	761 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	KAR9	P32526	644 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	COX13	P32799	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	YKL097C	P34245	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	TOS3	P43637	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	NSE1	Q07913	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	YEL045C	P32616	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	MDE1	P47095	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	MEH1	Q02205	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	HRT3	Q12347	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	PFF1	P38244	976 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SDS24	P38314	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	SBE22	P38814	852 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	PAC11	P40960	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	MTQ1	P53944	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	IRC25	Q07951	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DSE3	YOR264W	CAP2	P13517	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YSC83	P32792	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	MRM2	P53123	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RCF1	Q03713	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	NDL1	Q06568	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	MDM36	Q06820	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	OPI3	P05375	206 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	MNL1	P38888	796 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	SDT1	P53078	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ALF1	P53904	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RNH203	Q12338	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	POM152	P39685	1337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	MRPL10	P36520	322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RXT2	P38255	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ATM1	P40416	690 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	LCB3	P47013	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	SPR6	Q01684	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	FDH1	Q08911	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	AHC1	Q12433	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	TPK3	P05986	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	PHA2	P32452	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YEF1	P32622	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	CSE2	P33308	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	DOA1	P36037	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	MLH1	P38920	769 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YGR117C	P53270	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ADA2	Q02336	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ECM7	Q06200	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RBD2	Q12270	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	EAF3	Q12432	401 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	LDB16	P25587	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	SKT5	P34226	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YHR131C	P38835	850 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YIP5	P53108	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	PUP2	P32379	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	WSS1	P38838	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	MAM33	P40513	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	EPL1	P43572	832 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	STE24	P47154	453 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	SHE10	P53075	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	RTT102	P53330	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	URC2	Q04411	772 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	ASA1	Q06822	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	LOT6	Q07923	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	AAD15	Q08361	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	IZH2	Q12442	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DSE3	YOR264W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	RIP-Chip
DSE3	YOR264W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.3 ms