RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI2	YOL007C	EPL1	P43572	832 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	RAX1	Q08760	435 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NFT1	P0CE68	1218 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	OPI1	P21957	404 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YCL068C	P25593	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SKN1	P33336	771 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	CHK1	P38147	527 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	QDR3	P38227	689 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	JLP2	P40206	208 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PRM5	P40476	318 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	TOS3	P43637	560 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ROG1	P53118	685 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	RTT102	P53330	157 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	TOF1	P53840	1238 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PBA1	Q05778	276 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	AAD15	Q08361	143 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YDR061W	Q12298	539 aa		2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MSP1	P28737	362 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	COX13	P32799	129 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YBL028C	P38202	106 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YBR137W	P38276	179 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YIL067C	P40514	678 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	REE1	P40893	198 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NCA3	P46955	337 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	BTN2	P53286	410 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MEH1	Q02205	184 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YPL107W	Q02873	248 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	IPK1	Q06667	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NCA2	Q12374	616 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	FRE6	Q12473	712 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SPT7	P35177	1332 aa		2.67	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.66	□□□□□ -1.98	not detected
CSI2	YOL007C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YSC83	P32792	385 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SKT5	P34226	696 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	DOA1	P36037	715 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	STP2	P38704	541 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	NDT80	P38830	627 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SIM1	P40472	476 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	CHS6	P40955	746 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YGR210C	P42942	411 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	STE24	P47154	453 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	TIS11	P47977	285 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	YGR117C	P53270	476 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MTM1	P53320	366 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	CCE1	Q03702	353 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	URC2	Q04411	772 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	MDM36	Q06820	579 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	RNH203	Q12338	110 aa		2.66	□□□□□ -1.98
CSI2	YOL007C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	DPH2	P32461	534 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	KAR9	P32526	644 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	YEF1	P32622	495 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	MNS1	P32906	549 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	YSW1	P38280	609 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	MNL1	P38888	796 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	CAJ1	P39101	391 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	COX14	P39103	70 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	ATM1	P40416	690 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	ALF1	P53904	254 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	ECM7	Q06200	448 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	LOT6	Q07923	191 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	YOR387C	Q08910	206 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	TRP1	P00912	224 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	CAP2	P13517	287 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	DAL2	P25335	343 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	PHA2	P32452	334 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	SPT10	P35208	640 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	YIL029C	P40538	142 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	MDE1	P47095	244 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	YIP5	P53108	310 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	YGR016W	P53209	190 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	MTQ1	P53944	314 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	SPR6	Q01684	191 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	MHR1	Q06630	226 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSI2	YOL007C	POM152	P39685	1337 aa		2.64	□□□□□ -1.99

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