RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	NCA2	Q12374	616 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	REV1	P12689	985 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	KAR9	P32526	644 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	SKN1	P33336	771 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	COX14	P39103	70 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	JEM1	P40358	645 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	YIL029C	P40538	142 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	TOS3	P43637	560 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	MTQ1	P53944	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	PEX25	Q02969	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CEX1	Q12453	761 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	NAM2	P11325	894 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YEL045C	P32616	141 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	not detected
YNL171C	YNL171C	COX13	P32799	129 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	STP2	P38704	541 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SIM1	P40472	476 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	CHS6	P40955	746 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MDE1	P47095	244 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	HRT3	Q12347	344 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YKL097C	P34245	136 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SWD3	P38123	315 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	QDR3	P38227	689 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SBE22	P38814	852 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ERO1	Q03103	563 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	IRC25	Q07951	179 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	CAP2	P13517	287 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	PHA2	P32452	334 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YSC83	P32792	385 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	PFF1	P38244	976 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	PAC11	P40960	533 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SDT1	P53078	280 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MRM2	P53123	320 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SPR6	Q01684	191 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MEH1	Q02205	184 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	RCF1	Q03713	159 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	NDL1	Q06568	189 aa		3.5	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	LDB16	P25587	256 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	CSE2	P33308	149 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ATM1	P40416	690 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ALF1	P53904	254 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ADA2	Q02336	434 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ECM7	Q06200	448 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MDM36	Q06820	579 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	FDH1	Q08911	376 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	RNH203	Q12338	110 aa		3.49	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	POM152	P39685	1337 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	OPI3	P05375	206 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MRPL10	P36520	322 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MNL1	P38888	796 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	STE24	P47154	453 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SHE10	P53075	577 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YGR117C	P53270	476 aa		3.48	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YEF1	P32622	495 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SKT5	P34226	696 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	DOA1	P36037	715 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	MAM33	P40513	266 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	AIM24	P47127	394 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YMR102C	Q03177	834 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	LOT6	Q07923	191 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	SMC5	Q08204	1093 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	EAF3	Q12432	401 aa		3.47	□□□□□ -1.85
YNL171C	YNL171C	TPK3	P05986	398 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RXT2	P38255	430 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YHR131C	P38835	850 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	WSS1	P38838	269 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	MLH1	P38920	769 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	HAC1	P41546	238 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	EPL1	P43572	832 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	LCB3	P47013	409 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	YIP5	P53108	310 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RTT102	P53330	157 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	URC2	Q04411	772 aa		3.46	□□□□□ -1.86
YNL171C	YNL171C	RBD2	Q12270	262 aa		3.46	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.1 ms