RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	VHS2	P40463	436 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YJR008W	P47085	338 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YGR149W	P48236	432 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YGL088W	P53151	121 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	COS1	P53822	381 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	OAZ1	Q02803	292 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CCE1	Q03702	353 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MRX8	Q05473	314 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	LDB17	Q12342	491 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.1	□□□□□ -2.39	not detected
EST1	YLR233C	CDC16	P09798	840 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	CLN1	P20437	546 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	GIT1	P25346	518 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	FUN26	P31381	517 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DBF4	P32325	704 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PTH2	P34222	208 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SKT5	P34226	696 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SOL2	P37262	315 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YAL037W	P39728	267 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RBG1	P39729	369 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VEL1	P53058	206 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MIX17	Q03667	156 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TAF12	Q03761	539 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VPS54	Q12071	889 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	FCY22	Q12119	530 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MCT1	Q12283	360 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	EAF3	Q12432	401 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SPS4	P09937	338 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MIG1	P27705	504 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TOA1	P32773	286 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	VHC1	P38329	1120 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	LYS14	P40971	790 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	UFE1	P41834	346 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	KEG1	P43614	200 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PHB2	P50085	310 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TWF1	P53250	332 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	ALF1	P53904	254 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	YMR155W	Q03795	547 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	PRM6	Q04705	352 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	MDM30	Q05930	598 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	HUA2	Q12134	243 aa		0.1	□□□□□ -2.39
EST1	YLR233C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.09	□□□□□ -2.4	not detected
EST1	YLR233C	CAP2	P13517	287 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CBS1	P14066	229 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	EPT1	P22140	391 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GEX1	P25596	615 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CMC1	P36064	111 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YKR032W	P36127	104 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MMS4	P38257	691 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RRT13	P40042	185 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PCL7	P40186	285 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	MET28	P40573	187 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RMI1	Q02685	241 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	GIP3	Q03016	1276 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YMR018W	Q04364	514 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CDD1	Q06549	142 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ASA1	Q06822	443 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YOR376W	Q08900	122 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SRO7	Q12038	1033 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RCN2	Q12044	265 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HIF1	Q12373	385 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YDL199C	Q12407	687 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	FOB1	O13329	566 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	ECM14	P38836	430 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	TOS3	P43637	560 aa		0.08	□□□□□ -2.4
EST1	YLR233C	VAC7	P53950	1165 aa		0.08	□□□□□ -2.4

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