RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL017W	YLL017W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SLY1	P22213	666 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YUR1	P26725	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SFH5	P47008	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	AZR1	P50080	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	TOF1	P53840	1238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	HXT11	P54862	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	IPK1	Q06667	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	HSL1	P34244	1518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	DAP2	P18962	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
YLL017W	YLL017W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YBR137W	P38276	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	MTC6	P38849	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YFL067W	P43537	175 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	MDE1	P47095	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	GOR1	P53839	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RRN11	Q04712	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RNH203	Q12338	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	CEX1	Q12453	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	STF1	P01098	86 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YSC83	P32792	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SKN1	P33336	771 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RTT102	P53330	157 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	URC2	Q04411	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	BCH1	Q05029	724 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RTT103	Q05543	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	ESA1	Q08649	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	PHO2	P07269	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	MNL1	P38888	796 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	SIM1	P40472	476 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YIP5	P53108	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	AAD15	Q08361	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RAX1	Q08760	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	REX3	Q12090	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YLL017W	YLL017W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	UIP5	P36137	443 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SIF2	P38262	535 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	KRE9	P39005	276 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	JLP2	P40206	208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	TOS3	P43637	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	STE24	P47154	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	TAF2	P23255	1407 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	YCL068C	P25593	260 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SDH3	P33421	198 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SCS3	P53012	380 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	NCA2	Q12374	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	CPR4	P25334	318 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	CPR3	P25719	182 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	CHK1	P38147	527 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	YIL067C	P40514	678 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	PMT5	P52867	743 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	ECM7	Q06200	448 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	MET5	P47169	1442 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	OPI3	P05375	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	YEL043W	P32618	956 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	COX13	P32799	129 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SKT5	P34226	696 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	YBL028C	P38202	106 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	PRM5	P40476	318 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	NCA3	P46955	337 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	YGR117C	P53270	476 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	BOR1	P53838	576 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	HER2	Q03557	464 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	CCE1	Q03702	353 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	SMA2	Q04658	369 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	NDE2	Q07500	545 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	ERV2	Q12284	196 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YLL017W	YLL017W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.48	□□□□□ -1.69	not detected

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms