RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	HXT9	P40885	567 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SLI1	P53304	468 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	HXT11	P54862	567 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SPP2	Q02521	185 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SHR3	Q02774	210 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PRM15	Q03262	622 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MSC2	Q03455	724 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SYO1	Q07395	620 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	BAG7	Q12128	409 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YOR029W	Q12243	111 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SAM35	P14693	329 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ADE1	P27616	306 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	PEX3	P28795	441 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RTC2	P38279	296 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YHR122W	P38829	231 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	LNP1	P38878	278 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	STE24	P47154	453 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	AMA1	P50082	593 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SPC98	P53540	846 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	VAC7	P53950	1165 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RNT1	Q02555	471 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MRP51	Q02950	344 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SNF6	P18888	332 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YCR015C	P25616	317 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	AIM26	P32858	118 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	AST1	P35183	429 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SPC97	P38863	823 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	MRX5	P47007	382 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	IBA57	P47158	497 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SIZ1	Q04195	904 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	ARP10	Q04549	284 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	POS5	Q06892	414 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	SNA4	Q07549	140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YDL144C	Q07589	356 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	NSE1	Q07913	336 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	GEP3	Q08622	556 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	UBA3	Q99344	299 aa		3.53	□□□□□ -1.84
YKL050C	YKL050C	RHO2	P06781	192 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	STE18	P18852	110 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RBK1	P25332	333 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CSM1	P25651	190 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	DUG2	P38149	878 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	LDB7	P38210	180 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ICS2	P38284	255 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PCA1	P38360	1216 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PFS1	P38872	237 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	NDC80	P40460	691 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PTR3	P43606	678 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	THI7	Q05998	598 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RUP1	Q12242	671 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RMD5	Q12508	421 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RAD1	P06777	1100 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SPE1	P08432	466 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CBF1	P17106	351 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	GPI12	P23797	304 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RRT12	P25381	491 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PTC6	P25646	442 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	SAF1	P38352	637 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YEL020C	P39994	560 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PIG2	P40187	538 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	PAC11	P40960	533 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	MRS2	Q01926	470 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	IZH1	Q03419	316 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YFT2	Q06676	274 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	CYK3	Q07533	885 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.52	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	TRP3	P00937	484 aa		3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
YKL050C	YKL050C	ABF1	P14164	731 aa		3.51	□□□□□ -1.85

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