RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A DFG10P40526 253 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A TCB2P48231 1178 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MRM2P53123 320 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ADA2Q02336 434 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CCE1Q03702 353 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PRP42Q03776 544 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RIF2Q06208 395 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A VPS54Q12071 889 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A AEP3Q12089 606 aa2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.03□□□□□ -2.08not detected
RPC10YHR143W-A HSP104P31539 908 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A DBF4P32325 704 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CYS4P32582 507 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MRP21P38175 177 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RTC2P38279 296 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MIG3P39943 394 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MAM33P40513 266 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A YFR057WP43625 151 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A MST27P53176 234 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A PRM6Q04705 352 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A LOT6Q07923 191 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A NCA2Q12374 616 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A ISA2Q12425 185 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A EAF3Q12432 401 aa2.03□□□□□ -2.08
RPC10YHR143W-A CAP2P13517 287 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SPT10P35208 640 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A HEL1P36113 551 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A ZTA1P38230 334 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A STN1P38960 494 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SER3P40054 469 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A ZIM17P42844 174 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A TOS3P43637 560 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A BIR1P47134 954 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A RRP46P53256 223 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YMR102CQ03177 834 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A AIM32Q04689 311 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YLR345WQ06137 509 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SMC5Q08204 1093 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A AHC1Q12433 566 aa2.02□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A CDC21P06785 304 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A DST1P07273 309 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A LTV1P34078 463 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A MID2P36027 376 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A INM1P38710 295 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A CHS6P40955 746 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A HAC1P41546 238 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A LCB3P47013 409 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A AIM24P47127 394 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A CLD1P53264 445 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YLR456WQ06199 204 aa2.01□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A POM152P39685 1337 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2□□□□□ -2.09 RIP-Chip
RPC10YHR143W-A ARO3P14843 370 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YEF1P32622 495 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A COX13P32799 129 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SKN1P33336 771 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YHK8P38776 514 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A BAT1P38891 393 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A PTI1P39927 425 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A OXA1P39952 402 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YGR111WP53265 400 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YGR117CP53270 476 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A LIP2Q06005 328 aa2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A RIM1P32445 135 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SKT5P34226 696 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A OM14P38325 134 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SRP72P38688 640 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A STP2P38704 541 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A FAD1P38913 306 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YER186CP40101 306 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A EGT2P42835 1041 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A ATG18P43601 500 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A BNS1P50084 137 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A PIB2P53191 635 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A CRH1P53301 507 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A TDA1Q03533 586 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YET2Q04210 160 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A NSE1Q07913 336 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A UAF30Q08747 228 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A YCR024C-BQ3E7Z8 88 aa1.99□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A PSK1P31374 1356 aa1.98□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A COX4P04037 155 aa1.98□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A ALG1P16661 449 aa1.98□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A SLM5P25345 492 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
RPC10YHR143W-A CDC50P25656 391 aa1.98□□□□□ -2.09
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