RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CLN3	P13365	580 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YCR007C	P25354	239 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	IMG1	P25626	169 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	FRE1	P32791	686 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	COT1	P32798	439 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MLH1	P38920	769 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	END3	P39013	349 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SER3	P40054	469 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SLD5	Q03406	294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	INP2	Q03824	705 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	DCS1	Q06151	350 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ARR1	Q06596	294 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YDL012C	Q12489	107 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	VPS63	O13549	108 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RHO2	P06781	192 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	HEM15	P16622	393 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MEI5	P32489	222 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ECM25	P32525	599 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	DOA4	P32571	926 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RPC37	P36121	282 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RFC3	P38629	340 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	FAD1	P38913	306 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	VHS2	P40463	436 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SIM1	P40472	476 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YIL067C	P40514	678 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YGL114W	P53134	725 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	PIB2	P53191	635 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CUR1	Q06469	252 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	NDL1	Q06568	189 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ESA1	Q08649	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RBD2	Q12270	262 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	APC2	Q12440	853 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SGS1	P35187	1447 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MRP13	P12686	339 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
NEM1	YHR004C	THI2	P38141	450 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CIN4	P39110	191 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	INA22	P40576	216 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ECM27	P47144	725 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	GTO1	P48239	356 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	TOM22	P49334	152 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	VOA1	P53262	265 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SHY1	P53266	389 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	APC4	Q04601	652 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SIL1	Q08199	421 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	VAM3	Q12241	283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	KSS1	P14681	368 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	UGA1	P17649	471 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	VHC1	P38329	1120 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	REE1	P40893	198 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YJR154W	P47181	346 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MPS2	P53159	387 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CAF40	P53829	373 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CSI1	Q04368	295 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	IVY1	Q04934	453 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	BOP2	Q06150	570 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YLR173W	Q06247	608 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MDM36	Q06820	579 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	UNG1	P12887	359 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	RSR1	P13856	272 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	HIR2	P32480	875 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	SDH3	P33421	198 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	YKL070W	P36087	169 aa		3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
NEM1	YHR004C	MSG5	P38590	489 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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