RNA–Protein interactions for RNA: YDR062W

LCB2, Transcript of Component of serine palmitoyltransferase, yeast

Gene LCB2, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB2	YDR062W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SCC4	P40090	624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	TOS3	P43637	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	TRS85	P46944	698 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SOL4	P53315	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	KIN4	Q01919	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	NUP53	Q03790	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	KRE5	P22023	1365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	DST1	P07273	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RSR1	P13856	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SPS22	P25380	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	FRE1	P32791	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	BUD2	P33314	1104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	UBP8	P50102	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RHO4	Q00246	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	URC2	Q04411	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SWF1	Q04629	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ECM7	Q06200	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	GEP3	Q08622	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ACF2	Q12168	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	GLE1	Q12315	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	FRE7	Q12333	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	CDC42	P19073	191 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	RPB8	P20436	146 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	KIN3	P22209	435 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MSK1	P32048	576 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	PHO90	P39535	881 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YAL037W	P39728	267 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	HXT9	P40885	567 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	LOH1	P47055	219 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	KEL2	P50090	882 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	INP2	Q03824	705 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	URH1	Q04179	340 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	SYO1	Q07395	620 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	IMA2	Q08295	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	MED4	Q12343	284 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	FMP16	Q12497	93 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LCB2	YDR062W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YUR1	P26725	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SNC1	P31109	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YMC1	P32331	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RTC2	P38279	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RCY1	P39531	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	FAU1	P40099	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	ARP10	Q04549	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	TMN2	Q04562	672 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RRN11	Q04712	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	BCP1	Q06338	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SSK1	Q07084	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	OPI3	P05375	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PPZ1	P26570	692 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	DOA4	P32571	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	UTR4	P32626	227 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MSN4	P33749	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PEX32	P38292	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PMT5	P52867	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RET3	P53600	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YNL050C	P53952	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	MRPL25	P23369	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	VPS3	P23643	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RAD51	P25454	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SPR1	P32603	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	RPC25	P35718	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	SDS3	P40505	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	INA22	P40576	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCB2	YDR062W	YDL186W	P48568	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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