RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287777.4

KLHL40-201, Transcript of kelch like family member 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHL40, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40-201ENST00000287777 GANQ9H2C0 597 aa20.52■□□□□ 0.88
KLHL40-201ENST00000287777 MYH10P35580 1976 aa20.52■□□□□ 0.88
KLHL40-201ENST00000287777 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.52■□□□□ 0.88
KLHL40-201ENST00000287777 PPIP5K2O43314 1243 aa20.52■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 HOXD13P35453 343 aa20.52■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.52■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.52■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 MYBP10242 640 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 COG1Q8WTW3 980 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 EML1O00423 815 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 MAP9Q49MG5 647 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.51■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 PDXKO00764 312 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 EYA4O95677 639 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RSPH10BP0C881 870 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 NOX5Q96PH1 765 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ERICH4A6NGS2 130 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ITIH3Q06033 890 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ACER1Q8TDN7 264 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RGL1Q9NZL6 768 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TRAF1Q13077 416 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 WDR18Q9BV38 432 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TMX2Q9Y320 296 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 BUB1O43683 1085 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 SPDYE6P0CI01 402 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 GOPCQ9HD26 462 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 CLRN2A0PK11 232 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 CFBP00751 764 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 GYS2P54840 703 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ASIC2Q16515 512 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 SLC18A3Q16572 532 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TBC1D5Q92609 795 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ASTN1O14525 1302 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 NCK2O43639 380 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ZMYND10O75800 440 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 CCDC174Q6PII3 467 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TLR10Q9BXR5 811 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 GCNT3O95395 438 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 NR3C1P04150 777 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ACTN1P12814 892 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 ARID5AQ03989 594 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 FAM151AQ8WW52 585 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 PSMB7Q99436 277 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHL40-201ENST00000287777 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.8 ms