RNA–Protein interactions for RNA: YPL134C

ODC1, Transcript of Mitochondrial inner membrane transporter, yeastyeast

Gene ODC1, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ODC1YPL134C BUR6P40096 142 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C IME4P41833 600 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C AAD14P42884 376 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YFL052WP43551 465 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C IRC7P43623 340 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YJR124CP47159 448 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PRP24P49960 444 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C NBP35P52920 328 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C LSM7P53905 115 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.33□□□□□ -1.08not detected
ODC1YPL134C FDC1Q03034 503 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YMR087WQ04299 284 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MFB1Q04922 465 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PDR8Q06149 701 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YLR031WQ07978 186 aa8.33□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C CYC1P00044 109 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PHO5P00635 467 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RAD52P06778 471 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C STE3P06783 470 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C SYP1P25623 870 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data8.32□□□□□ -1.08not detected
ODC1YPL134C PET309P32522 965 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MSN2P33748 704 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PHO11P35842 467 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C APM3P38153 483 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YBR225WP38321 900 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PHO12P38693 467 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C UBA4P38820 440 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PLB1P39105 664 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MXR1P40029 184 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C GDS1P41913 522 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ATG18P43601 500 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C NUP116Q02630 1113 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C SNZ1Q03148 297 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C AIM36Q03798 255 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C SPO77Q06134 477 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ASR1Q06834 288 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ATP14Q12349 124 aa8.32□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C AI4P03878 556 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MCM1P11746 286 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MRPL8P22353 238 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MIH1P23748 554 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RRP7P25368 297 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ARE1P25628 610 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C SNC1P31109 117 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ALY1P36117 915 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MRPL3P36516 390 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C IFA38P38286 347 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C LSM12P38828 187 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C NDE1P40215 560 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C TIR3P40552 269 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C HXT9P40885 567 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C APS3P47064 194 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C STE24P47154 453 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C AMA1P50082 593 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RRN9P53437 365 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YPL034WQ03083 165 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C HEH2Q03281 663 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C GCN5Q03330 439 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YLR283WQ05867 314 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C VPS74Q06385 345 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C FEX1Q08913 375 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PST1Q12355 444 aa8.31□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C SPS2P08459 502 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PET54P10834 293 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C BIO2P32451 375 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C LYP1P32487 611 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C LHP1P33399 275 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C APT2P36973 181 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C TIM54P47045 478 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YJL043WP47053 257 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C RSC3Q06639 885 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YLR012CQ07927 99 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C FRE5Q08908 694 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MRX4Q12467 430 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C MTR10Q99189 972 aa8.3□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C SWI5P08153 709 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C FUM1P08417 488 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C DSF1P0CX08 502 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YNR073CP0CX09 502 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YAR066WP0CX18 203 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C YHR214WP0CX19 203 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C CMP2P14747 604 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C PPH22P23595 377 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C CPR3P25719 182 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ASH1P34233 588 aa8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ODC1YPL134C BIG1P38813 335 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.7 ms