RNA–Protein interactions for RNA: YOR184W

SER1, Transcript of 3-phosphoserine aminotransferase, yeast

Gene SER1, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SER1	YOR184W	CDC5	P32562	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	PTH2	P34222	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	SEF1	P34228	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	APT2	P36973	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	CTP1	P38152	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	RPS27B	P38711	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	PTR3	P43606	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	FAR3	P46671	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	ROG1	P53118	685 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	FAR8	Q05040	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	VHS3	Q08438	674 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	ENV7	Q12003	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
SER1	YOR184W	HSP42	Q12329	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	SPE4	Q12455	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	DST1	P07273	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	ALG7	P07286	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	ARE1	P25628	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	SRB5	P32585	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	YBR071W	P38243	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	BMT2	P38278	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	IKS1	P47042	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	ASK10	P48361	1146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	BIO3	P50277	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	RSF1	Q05043	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	VID22	Q05934	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	MCH5	Q08777	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	NCA2	Q12374	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SER1	YOR184W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	COS2	P0CX12	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	COS3	P0CX13	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	NMT1	P14743	455 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	OCA4	P25366	362 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MGR1	P25573	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	YHR112C	P38716	378 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MET18	P40469	1032 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	PRM10	P42946	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	COS4	P43542	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TEL2	P53038	688 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	GTR2	P53290	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	SLM2	P53955	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TVP15	Q03860	143 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	PDR8	Q06149	701 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	REX4	Q08237	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	RUP1	Q12242	671 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	COX1	P00401	534 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MET3	P08536	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TOP3	P13099	656 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	VPS33	P20795	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	YMC1	P32331	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	CAB3	P36076	571 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	ATG7	P38862	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MAD2	P40958	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	PAC11	P40960	533 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MEP2	P41948	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	LCL3	P53153	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MET31	Q03081	177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MSC1	Q03104	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	GLO2	Q05584	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	BOP2	Q06150	570 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	REH1	Q06709	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	ACF2	Q12168	779 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	COR1	P07256	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SER1	YOR184W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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