RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	HSM3	P38348	480 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
YNL057W	YNL057W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YIL001W	P40560	513 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	SHR5	P41912	237 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	PGU1	P47180	361 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YGR053C	P53234	283 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	MAL12	P53341	584 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YLR460C	P54007	376 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	MET31	Q03081	177 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	SWF1	Q04629	336 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YET3	Q07451	203 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YEH1	Q07804	573 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	NMD4	Q12129	218 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	SFG1	Q12507	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	RGS2	Q99188	309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YOS9	Q99220	542 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
YNL057W	YNL057W	ERD1	P16151	362 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	HSP150	P32478	413 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TPO5	P36029	618 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	MNN2	P38069	597 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	ETR1	P38071	380 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TDP1	P38319	544 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TRR2	P38816	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	PZF1	P39933	429 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	FKH2	P41813	862 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	KEL2	P50090	882 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TPC1	P53257	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YNR040W	P53736	256 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	RDR1	Q08904	546 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YNL057W	YNL057W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	HEM15	P16622	393 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SAC7	P17121	654 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PET123	P17558	318 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MEF1	P25039	761 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COX13	P32799	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YMR262W	P38430	313 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	ARN2	P38724	620 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YJL206C	P39529	758 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	COA1	P40452	197 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	INA22	P40576	216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	AXL1	P40851	1208 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	GCD10	P41814	478 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YNL320W	P42840	284 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PRY1	P47032	299 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	TOM22	P49334	152 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	AIF1	P52923	378 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CDH1	P53197	566 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SDC1	Q03323	175 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PLM2	Q04383	521 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SML1	Q04964	104 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SEC10	Q06245	871 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PSF1	Q12488	208 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	SKS1	Q12505	502 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	DST1	P07273	309 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	MET2	P08465	486 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CTA1	P15202	515 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	CWH43	P25618	953 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	PHA2	P32452	334 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	IME2	P32581	645 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YNL057W	YNL057W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.9 ms