RNA–Protein interactions for RNA: YKL149C

DBR1, Transcript of RNA lariat debranching enzyme, yeast

Gene DBR1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DBR1	YKL149C	PMT1	P33775	817 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	SIP3	P38717	1229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	MDM31	P38880	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	HXT14	P42833	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	RTC4	P53850	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	PLP2	Q12017	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	RED1	P14291	827 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	ERG3	P32353	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	NPL6	P32832	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	YKL097C	P34245	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	MMS4	P38257	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	YER186C	P40101	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	RPR2	P40571	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	RTT103	Q05543	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	VPS74	Q06385	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	CUR1	Q06469	252 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	RTN2	Q12443	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	MAS1	P10507	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	EXO70	P19658	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	YSC83	P32792	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	COY1	P34237	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	RPH1	P39956	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	URB2	P47108	1174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	YDL186W	P48568	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	COS10	P52924	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	YGL108C	P53139	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	ADA2	Q02336	434 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	IRC15	Q02733	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	PPT2	Q12036	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	SCM3	Q12334	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	LAA1	P39526	2014 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DBR1	YKL149C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	YCR022C	P25620	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	ATS1	P31386	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	VPS20	Q04272	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	NSE1	Q07913	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RKM5	Q12367	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	SET6	Q12529	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	IME2	P32581	645 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	JNM1	P36224	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	HAT2	P39984	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	FAU1	P40099	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	SYG1	P40528	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	VTC2	P43585	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	ARK1	P53974	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	AYT1	Q12226	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	TEL1	P38110	2787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	NUM1	Q00402	2748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	ATR1	P13090	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	VPS3	P23643	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	PEX34	P25584	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	PMU1	P36069	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	SHO1	P40073	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	ALG8	P40351	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	YJL213W	P40896	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
DBR1	YKL149C	SHS1	Q07657	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RHO2	P06781	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	BUB3	P26449	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RAD14	P28519	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	NFU1	P32860	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	YHR054C	P38780	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	ELP2	P42935	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	GWT1	P47026	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	HST1	P53685	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	CTF3	Q12748	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DBR1	YKL149C	HEM2	P05373	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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