RNA–Protein interactions for RNA: YKL146W

AVT3, Transcript of Vacuolar transporter, yeast

Gene AVT3, Length 2,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT3	YKL146W	MRPL33	P20084	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	BUB3	P26449	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SSO1	P32867	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	BAP2	P38084	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SLM4	P38247	162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RCK1	P38622	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YHL012W	P38709	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
AVT3	YKL146W	PRM10	P42946	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PMT4	P46971	762 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GPI8	P49018	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	TOM22	P49334	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PDR8	Q06149	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RAD7	P06779	565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	STE7	P06784	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ALG7	P07286	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SNF4	P12904	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ARE1	P25628	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	EHT1	P38295	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	LRO1	P40345	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PAC11	P40960	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ELP2	P42935	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RMR1	P53060	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SUN4	P53616	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YML096W	Q04489	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	NDL1	Q06568	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	LAG2	Q92325	660 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GAL7	P08431	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	CLB4	P24871	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	DMC1	P25453	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	CTS1	P29029	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SFA1	P32771	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SEC61	P32915	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	NIC96	P34077	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MNN2	P38069	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YHR112C	P38716	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	VRG4	P40107	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	LAS21	P40367	830 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	VHR1	P40522	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SNL1	P40548	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YJL043W	P47053	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MRK1	P50873	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MSC1	Q03104	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	BOP2	Q06150	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MLC2	Q06580	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YDL129W	Q07555	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	XYL2	Q07993	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	THP1	Q08231	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	DIN7	Q12086	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GAL3	P13045	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PTP1	P25044	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	NTG1	P31378	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SKN1	P33336	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MDJ1	P35191	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SPC34	P36131	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	BNA4	P38169	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SWD1	P39706	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	NEO1	P40527	1151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YPS6	P40583	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	AGP3	P43548	558 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RAD17	P48581	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ROG1	P53118	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SPR6	Q01684	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MFB1	Q04922	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ARR1	Q06596	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GIC2	Q06648	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	PUS9	Q12069	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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