RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W FRE2P36033 711 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MRPL40P36534 297 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YBR056WP38081 501 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RIM2P38127 377 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YAL037WP39728 267 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YPS6P40583 537 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PHB2P50085 310 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YIP1P53039 248 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ESBP6P53918 673 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W GPI15P53961 229 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W IRC15Q02733 499 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W IMA2Q08295 589 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W AAD15Q08361 143 aa3.24□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PUT4P15380 627 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SAG1P20840 650 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SLM5P25345 492 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W CTR86P25355 563 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PSO2P30620 661 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PPQ1P32945 549 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W STP2P38704 541 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W VPS52P39904 641 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YIL169CP40442 995 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W AZF1P41696 914 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YFR018CP43599 363 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RTT102P53330 157 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W BET4Q00618 327 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
SNX4YJL036W PNG1Q02890 363 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MMT1Q03218 510 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YMR087WQ04299 284 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SGT1Q08446 395 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ATG34Q12292 412 aa3.23□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W OPI3P05375 206 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W GAL7P08431 366 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MAS1P10507 462 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SAM1P10659 382 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W THR4P16120 514 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ERG1P32476 496 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YHR177WP38867 453 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.22□□□□□ -1.89not detected
SNX4YJL036W SSO2P39926 295 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W PCL6P40038 420 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SNL1P40548 159 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W STD1Q02794 444 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W URH1Q04179 340 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W VPS20Q04272 221 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W BNA5Q05979 453 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W ECM7Q06200 448 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W VPS74Q06385 345 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W GLE1Q12315 538 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RNH203Q12338 110 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W YOR012WQ12351 137 aa3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNX4YJL036W VPS63O13549 108 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W OM45P16547 393 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W DBP3P20447 523 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YCR100CP25606 316 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W SKN1P33336 771 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W SPT10P35208 640 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W SAD1P43589 448 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W GWT1P47026 490 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YHC3P47040 408 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W FRE4P53746 719 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YNL146WP53906 100 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W BET5Q03630 159 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W URC2Q04411 772 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YMR317WQ04893 1140 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YLR281CQ05863 155 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YLR297WQ05899 129 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W SYO1Q07395 620 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YEH2Q07950 538 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YDL009CQ12210 107 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W CSR2Q12734 1121 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa3.21□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W RNR2P09938 399 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W RPL12BP0CX54 165 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YFL068WP0CX99 160 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W PET18P25362 215 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W LSB5P25369 354 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W HMX1P32339 317 aa3.2□□□□□ -1.9
SNX4YJL036W VPS45P38932 577 aa3.2□□□□□ -1.9
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