RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	GIM3	P53900	129 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	COS7	Q07788	383 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YPL272C	Q08984	517 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ERV2	Q12284	196 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	HRT3	Q12347	344 aa		3.62	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	DAP2	P18962	818 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	VPS3	P23643	1011 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PRD1	P25375	712 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SSO2	P39926	295 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PTR3	P43606	678 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	DIA3	P52290	468 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	IRC15	Q02733	499 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ATC1	Q04005	294 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YMR130W	Q04223	302 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MSC3	Q05812	728 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RAD61	Q99359	647 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CHD1	P32657	1468 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PET18	P25362	215 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RDS1	P25611	832 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	HMX1	P32339	317 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PFF1	P38244	976 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MMS4	P38257	691 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	TCD1	P38756	429 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PEX18	P38855	283 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YFL067W	P43537	175 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YFR018C	P43599	363 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	IPI3	P53877	555 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YNL143C	P53908	130 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ACL4	Q03771	387 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	VPS20	Q04272	221 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ECM18	Q04623	453 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	TEN1	Q07921	160 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RLM1	Q12224	676 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	EXO70	P19658	623 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	URA4	P20051	364 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	ICS2	P38284	255 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	PET100	P38958	111 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	RIP-Chip
NEM1	YHR004C	EFM3	P47163	339 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	EFM6	P53970	246 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	TMS1	Q12116	473 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	MED4	Q12343	284 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEM1	YHR004C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SPS4	P09937	338 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	PPH22	P23595	377 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SNT1	P25357	1226 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RAD14	P28519	371 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ARA1	P38115	344 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MSR1	P38714	643 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	HAT2	P39984	401 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YHC3	P47040	408 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RRT8	Q08219	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SRN2	Q99176	213 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	CLN1	P20437	546 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MRPL25	P23369	157 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	BOS1	P25385	244 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	KKQ8	P36004	724 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MRPL37	P36532	105 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SWD3	P38123	315 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ELP2	P42935	788 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	SNG1	P46950	547 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	BRO1	P48582	844 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	ABZ2	Q03266	374 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	BCP1	Q06338	283 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	MTR10	Q99189	972 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEM1	YHR004C	STE3	P06783	470 aa		3.56	□□□□□ -1.84

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