RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SLT2	Q00772	484 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BNA7	Q04066	261 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SEC63	P14906	663 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PTC6	P25646	442 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
SYF1	YDR416W	YKL071W	P36086	256 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	AIM29	P36154	155 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MAL32	P38158	584 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	QDR3	P38227	689 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	EFM2	P38347	419 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	STE24	P47154	453 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MAL12	P53341	584 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	COX20	Q04935	205 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PEX27	Q08580	376 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RUP1	Q12242	671 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.97	□□□□□ -1.77	not detected
SYF1	YDR416W	RAP1	P11938	827 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GSY2	P27472	705 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GMH1	P36125	273 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YHR177W	P38867	453 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MTW1	P39731	289 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	PAC11	P40960	533 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	AMA1	P50082	593 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BUD17	P53727	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RTC4	P53850	401 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	ERG5	P54781	538 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BET4	Q00618	327 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	AFT2	Q08957	416 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	LCB4	Q12246	624 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GLE1	Q12315	538 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TRM13	Q12383	476 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RAV1	P47104	1357 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	CNA1	P23287	553 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	FUB1	P25659	250 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SAF1	P38352	637 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SBE22	P38814	852 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GAT2	P40209	560 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	YJL118W	P47022	219 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	RMR1	P53060	241 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	TAF12	Q03761	539 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GIM5	Q04493	163 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	FUS2	Q05670	677 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	SYO1	Q07395	620 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	NUP192	P47054	1683 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	YDR416W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	APA2	P22108	325 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.96	□□□□□ -1.78	not detected
SYF1	YDR416W	RRN10	P38204	145 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RTC2	P38279	296 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PRM9	P39551	298 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ATG4	P53867	494 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YMR187C	Q03236	431 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	SHS1	Q07657	551 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	COX2	P00410	251 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RAD3	P06839	778 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	CDC6	P09119	513 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RTT107	P38850	1070 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	LAS21	P40367	830 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	GLG2	P47011	380 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YDL186W	P48568	277 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RAX1	Q08760	435 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ATP10	P18496	279 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PBN1	P25580	416 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ATP11	P32453	318 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PPS1	P38148	807 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YMR262W	P38430	313 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	FET3	P38993	636 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	UBC11	P52492	156 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YIP4	P53093	235 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YML053C	Q04978	212 aa		3.95	□□□□□ -1.78

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