RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 COG5Q9UP83 839 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 INSL6Q9Y581 213 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 TRANK1O15050 2925 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 ADAM17P78536 824 aa19.43■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 SKAP1Q86WV1 359 aa19.43■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 MICU3Q86XE3 530 aa19.43■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 HLA-CQ95604 372 aa19.43■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 CDHR1Q96JP9 859 aa19.43■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 C17orf80Q9BSJ5 609 aa19.42■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa19.42■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa19.42■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa19.41■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 SEPT1Q8WYJ6 367 aa19.41■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 UPP2O95045 317 aa19.4■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.4■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
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HERC3-211ENST00000513325 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
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HERC3-211ENST00000513325 KAT6AQ92794 2004 aa19.35■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 IGBP1P78318 339 aa19.35■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 MGAT3Q09327 533 aa19.35■□□□□ 0.69
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HERC3-211ENST00000513325 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB10Q96DT7 871 aa19.35■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A2Q9UBY0 812 aa19.35■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 STXBP3O00186 592 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 ARP10275 920 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 INSRRP14616 1297 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 GPM6BQ13491 265 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 TSGA10IPQ3SY00 556 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R18Q6NYC8 613 aa19.34■□□□□ 0.69
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