RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CIITAP33076 1130 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 USP11P51784 963 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 HIC1Q14526 733 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OXER1Q8TDS5 423 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SCLYQ96I15 445 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF577Q9BSK1 485 aa28.41■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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HTATSF1-202ENST00000425695 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ACTR2P61160 394 aa28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 GLG1Q92896 1179 aa28.4■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 MARK3P27448 753 aa28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SETQ01105 290 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT25Q7Z3Z0 450 aa28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RETREG2Q8NC44 543 aa28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.39■■■□□ 2.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.38■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 BFSP2Q13515 415 aa28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 INF2Q27J81 1249 aa28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 SETD4Q9NVD3 440 aa28.38■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 ST18O60284 1047 aa28.37■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 IL23AQ9NPF7 189 aa28.37■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 TDP2O95551 362 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 LRCH3Q96II8 777 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 BACH2Q9BYV9 841 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.36■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 KAT6AQ92794 2004 aa28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 LGR5O75473 907 aa28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT2P35908 639 aa28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 NR5A1Q13285 461 aa28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 PTK7Q13308 1070 aa28.35■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 LRIT3Q3SXY7 679 aa28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM240Q5SV17 173 aa28.35■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.35■■■□□ 2.13
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.35■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 IQCF3P0C7M6 154 aa28.34■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 KRT40Q6A162 431 aa28.34■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 GUCY1B3Q02153 619 aa28.33■■■□□ 2.13
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HTATSF1-202ENST00000425695 PPFIA1Q13136 1202 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SERINC5Q86VE9 423 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 VWCEQ96DN2 955 aa28.31■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 GAS7O60861 476 aa28.3■■■□□ 2.12
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