RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	RBD2	Q12270	262 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RCN1	P36054	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YHR078W	P38799	552 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ROM1	P53046	1155 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	GMH1	P36125	273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YMD8	Q03697	442 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	IML3	P38265	245 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	PFA3	P42836	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	GCV1	P48015	400 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RTS3	P53289	263 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	MAK3	Q03503	176 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RCF1	Q03713	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SGO1	Q08490	590 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	TRM8	Q12009	286 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	BIO3	P50277	480 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YNL034W	P53963	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SPO77	Q06134	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ALG7	P07286	448 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SIR1	P21691	654 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	PMT1	P33775	817 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	DSF2	P38213	736 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	GIC1	P38785	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	COG7	P53195	279 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ORM1	P53224	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	MER1	P16523	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	GIT1	P25346	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YCL049C	P25577	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	GPX2	P38143	162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	STP2	P38704	541 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	HOC1	P47124	396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ATG29	Q12092	213 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YLR125W	Q12138	136 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	TSC13	Q99190	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YJU3	P28321	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ARO7	P32178	256 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	DDI1	P40087	428 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	NDE1	P40215	560 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	AZF1	P41696	914 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SWF1	Q04629	336 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	PEX10	Q05568	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YLR036C	Q07986	203 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	HIP1	P06775	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	KIN3	P22209	435 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	RSM7	P47150	247 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	YPL071C	Q02864	156 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	GAD1	Q04792	585 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	FMP23	P38231	175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	FCY21	P40039	528 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	NSE5	Q03718	556 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	ARG7	Q04728	441 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	NFI1	Q12216	726 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PUT4	YOR348C	SAM35	P14693	329 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	URK1	P27515	501 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	RET2	P43621	546 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	BIT61	P47041	543 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	BIR1	P47134	954 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	CPR8	P53728	308 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	PNS1	Q12412	539 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	ACH1	P32316	526 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	QDR2	P40474	542 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	SSY5	P47002	699 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	MSE1	P48525	536 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	FLC3	P53121	802 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	YGR168C	P53293	376 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	ZRG17	P53735	605 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	YNR065C	P53751	1116 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	TMN2	Q04562	672 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	ACF2	Q12168	779 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.5	□□□□□ -0.25	not detected
PUT4	YOR348C	MUM2	P38236	366 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	GDH3	P39708	457 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	RRG9	P40156	214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	KXD1	P53158	218 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	OAZ1	Q02803	292 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PUT4	YOR348C	TEN1	Q07921	160 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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