RNA–Protein interactions for RNA: YNL174W

YNL174W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL174W, Length 573 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL174W	YNL174W	TAF12	Q03761	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	TVP15	Q03860	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SEC10	Q06245	871 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	MCP2	Q06567	569 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	UBX3	Q12229	455 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	MDY2	Q12285	212 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RHO2	P06781	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	NMT1	P14743	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PHO3	P24031	467 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	MNE1	P24720	663 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ALY1	P36117	915 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	LDB7	P38210	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RFC3	P38629	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	IMA5	P40884	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	EMC4	P53073	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	COG1	P53079	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	BOL2	P53082	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	IPI3	P53877	555 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	GTR1	Q00582	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	OSH6	Q02201	448 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	NHP10	Q03435	203 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	TRI1	Q05024	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PMR1	P13586	950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	MRPL9	P31334	269 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	STB6	P36085	766 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	EFM1	P38732	585 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	XBP1	P40489	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	IME4	P41833	600 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	FLC3	P53121	802 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ACS1	Q01574	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SPP2	Q02521	185 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RMI1	Q02685	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RAD33	Q04231	177 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SPC24	Q04477	213 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ENT2	Q05785	613 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	VTA1	Q06263	330 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ENT4	Q07872	247 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PER33	Q12144	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ICT1	Q12385	394 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RMD5	Q12508	421 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	HEM2	P05373	342 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SEC63	P14906	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	EXO70	P19658	623 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PTM1	P32857	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	BZZ1	P38822	633 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	STN1	P38960	494 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	PET130	P47065	347 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	COG7	P53195	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	NNF2	P53253	936 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	CLD1	P53264	445 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	ATP23	P53722	227 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	IBD2	P53892	351 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	GOT1	Q03554	138 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	GTB1	Q04924	702 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	BLS1	Q06071	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	CRT10	Q08226	957 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL174W	YNL174W	SEM1	O94742	89 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	MSF1	P08425	469 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	RAD14	P28519	371 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	BRF1	P29056	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	TFC3	P34111	1160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	SKT5	P34226	696 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	ARP1	P38696	384 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YNL174W	YNL174W	FRT2	P39734	528 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.2 ms